| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,818,548 | A→G | intergenic (+36648/+16836) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,818,548 | 0 | A | G | 100.0% | 181.5 / NA | 63 | intergenic (+36648/+16836) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/32); total (31/32) | |||||||||||
CTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCAAATTTTCCTGAAGCCGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCAT > 1/1818313‑1818792 | cTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCTAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATCTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGcg < 1:889483/251‑2 (MQ=255) 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cTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATaa < 1:813005/251‑1 (MQ=255) tctcCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGaaa > 1:735535/1‑251 (MQ=255) ctcCCGCTTAGTGCGAATTTTCCTGAAGCGGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTCTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAATCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAg > 1:823944/1‑251 (MQ=255) 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CTAATATTGGTAATTGATCTTTTTCAACAGCTTCCAATAAAGATTTATAACGAAATTCCTCCAGTTTAGCTTGAGAAAGCGATGTCTTCGTTTTTAACGTATCCGCTTCGGCACCAAGTGCGGTCAGTTTTAACAATAGTTCACCCTTTTTCACGTATTCGCCCTCTTTCACAAAAATATGTTTAACCAATGAATTTTCAATCGGTTTAATTTCTTTGCTTCTCCCGCTTAGTGCAAATTTTCCTGAAGCCGTTGCGATAATTTCCACATTGCTAAAGATAGAAACAATAATCGCTAAAGTTAAAAAGAGCATAATGGAATAAGACACGAATCGTGGTGCATTTGATACAGGTGTTTCAATTAATTCCAAATGCGCGGGCAGAAATTCATTTTCATCTTTTTCTCTAACCGGAGAATCAAGCTGTTTACGAATTTTCCAAGTTTCATTCCACACGTTTTTATAACGGGAAAGCACATCAT > 1/1818313‑1818792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |