| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,817,870 | T→C | intergenic (+35970/+17514) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,817,870 | 0 | T | C | 100.0% | 259.6 / NA | 84 | intergenic (+35970/+17514) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/39); total (45/39) | |||||||||||
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gTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTtatat < 1:275376/201‑1 (MQ=255) gTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATActtc < 1:369886/206‑4 (MQ=255) gTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTaaaa > 1:136234/1‑250 (MQ=255) gTACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTaaaa > 1:871507/1‑250 (MQ=255) tACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAAc < 1:132765/250‑1 (MQ=255) tACCCGATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAAc < 1:767253/250‑1 (MQ=255) acccgATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAAc < 1:78280/120‑1 (MQ=255) acccgATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAAc < 1:627754/245‑1 (MQ=255) cccgATACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTtatat < 1:95729/195‑1 (MQ=255) aTACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATcc > 1:120990/1‑218 (MQ=255) aTACAGGGGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAACCGTATGt < 1:752268/251‑1 (MQ=255) 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tttttGTCCAGCTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCATTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACTTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTTTCTTCATCTAAAACCGTATGTTTTGCAATAGCATGTTCCTTATATAAGGCTCTAAAatcat > 1:178317/1‑250 (MQ=255) | ACCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCGACCTTAATTACAACCTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCAGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGGCACAACTACCATTAATGTTTCAGCCGTAGTAACAACGCCATCTATTGTGTGAACTTTTAATTGTTGTACAGTACCTGATACAGGAGCTCGAATTTCAGAGACTTGCTGGCGTTGATT‑GTTTTTGTCCAGTTCGAATGTCAATAAATTCACATTATCCGTCGCCTGTTTTAGCTTGTCTAAAATATCATTTTTGAACAATTGTGTGACTAATTCCTGCTCTTCTTTGGCCAATAAAACTTCGTTTTCAACTTGCATTAAACTCGCCTTATATACCTCAAGCTCATTGATTGCATCCTGATATTTATTCTCTTCATCTAAAACTGTATGTTTTGCAATAGCATGTTCCTTATATAAGGCTCTAAAATCAT > 1/1817624‑1818108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |