| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,817,498 | T→C | intergenic (+35598/+17886) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,817,498 | 0 | T | C | 100.0% | 153.6 / NA | 53 | intergenic (+35598/+17886) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/21); total (32/21) | |||||||||||
TAAATCCATCATCAAGTCACAGTTTTATACTGCCTAACCAAATCTATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGTGGAAAACCGGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTAAGTAGATAGCTTATAACGCTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCGGAAAGTGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATCGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCCGTTAAATAACCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCGACCTTAATTACAACCTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCAGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGG > 1/1817276‑1817740 | taAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGCGGAAAATCAGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAgtg < 1:142307/251‑1 (MQ=255) gtcTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGCGGAAAATCAGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTaaa > 1:773845/3‑251 (MQ=255) atcagAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGa < 1:695966/218‑1 (MQ=255) tcagAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATAc < 1:820679/202‑1 (MQ=255) gTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACtttt > 1:653710/1‑250 (MQ=255) atatTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTc > 1:690566/1‑200 (MQ=255) atTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGtt > 1:785456/1‑251 (MQ=255) aTCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCTTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAAt > 1:823336/1‑186 (MQ=255) taATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGt < 1:825647/216‑1 (MQ=255) aTTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAg < 1:308747/213‑1 (MQ=255) ttAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACggg > 1:868852/1‑251 (MQ=255) ctctTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATAc < 1:114736/169‑1 (MQ=255) ctctTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAatat < 1:635134/210‑1 (MQ=255) aaCTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATc < 1:31486/188‑1 (MQ=255) tttATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGtttttt > 1:461315/1‑131 (MQ=255) tATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCaataa > 1:65170/1‑144 (MQ=255) tATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAAcc < 1:486646/251‑1 (MQ=255) cAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAgggg < 1:503733/236‑1 (MQ=255) ttcttcTAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTAcga < 1:291475/251‑3 (MQ=255) cttctAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCaataa > 1:223849/1‑132 (MQ=255) cttctAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTc > 1:84242/1‑150 (MQ=255) cttctAATGGGCTGAGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAggg > 1:20637/1‑226 (MQ=255) gaGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAgt > 1:10140/2‑97 (MQ=255) gaGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTcc < 1:644696/185‑1 (MQ=255) gaGTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCcttctt > 1:764313/2‑251 (MQ=255) gTAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATAttt > 1:141682/1‑173 (MQ=255) tAGATAGCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCttt < 1:466010/249‑1 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCaataattg > 1:124982/1‑111 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAAt > 1:219724/1‑121 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATAc < 1:647205/123‑1 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTcaac > 1:570023/1‑213 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTAcgacgtc > 1:165696/1‑225 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACaaaa > 1:249985/1‑250 (MQ=255) gCTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACaaaa > 1:100005/1‑250 (MQ=255) cTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAgggg > 1:562379/1‑204 (MQ=255) cTTATAACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAAc > 1:648739/1‑250 (MQ=255) taACACTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAgggg < 1:326662/200‑1 (MQ=255) cTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGAtttc < 1:45819/59‑1 (MQ=255) tctcATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGt < 1:137014/147‑1 (MQ=255) tctcATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAgggg < 1:778622/193‑1 (MQ=255) tctcATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAata < 1:732004/244‑1 (MQ=255) tctcATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTAt > 1:298106/1‑251 (MQ=255) gTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAatat > 1:672038/1‑142 (MQ=255) gTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCCTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAg > 1:166058/1‑251 (MQ=255) tttCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTa < 1:349133/195‑1 (MQ=255) cAGTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTc < 1:508036/250‑1 (MQ=255) gTAATTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAg > 1:860082/1‑251 (MQ=255) aTTTCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGa > 1:354078/1‑251 (MQ=255) ttCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAAt > 1:391497/1‑251 (MQ=255) ttCCATCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAAt > 1:842815/1‑251 (MQ=255) tCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACg > 1:242093/1‑148 (MQ=255) tCCCTGCAGAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAAtctt > 1:701280/1‑249 (MQ=255) gcagAAAGCGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATTGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCTGTTAAGTAGCCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCAACCTTAATTACGACGTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCGGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCgg > 1:108567/4‑251 (MQ=255) | TAAATCCATCATCAAGTCACAGTTTTATACTGCCTAACCAAATCTATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGTGGAAAACCGGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTAAGTAGATAGCTTATAACGCTTCTCATGCCTGTCTTAATTTCTGCAGTAATTTCCATCCCTGCGGAAAGTGGGATTTCTTTTTCTTCGGTAGAAAGTGTTTTTTTATCCAATTCAATAATCGTATTAAATACAAGTCCAAGCTTTGGATGTTCAATCGCATCTAAAGTAATATTTTTCACTTTTCCCGTTAAATAACCATAACGGGTATAGGGGAAGGCTTCGACCTTAATTACAACCTCTTGCCCTTCTTTCACAAAACCAATATCTTTATTTTGAATAAGTGCAGTGACTTCAAGGGAATCTTCTTCCGG > 1/1817276‑1817740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |