| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,809,113 | T→C | intergenic (+27213/+26271) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,809,113 | 0 | T | C | 100.0% | 224.5 / NA | 75 | intergenic (+27213/+26271) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/28); total (47/28) | |||||||||||
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(MQ=255) gTATTATCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCACCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAg > 1:503553/1‑250 (MQ=255) gTATTATCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCACCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAg > 1:327388/1‑250 (MQ=255) gTATTATCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCACCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAg > 1:887379/1‑250 (MQ=255) tattatCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGAAGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCGCCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAGcc < 1:720856/251‑1 (MQ=255) tatCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGaaa > 1:125439/1‑81 (MQ=255) tatCCAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCACCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAGCcaca > 1:366950/1‑251 (MQ=255) | TAGTTCAACGTCCATACATATTCTCCTGGTTAATATATCGTTGTAGGTTTACAACATAAATGATTACATGAAAACTTGTGTGCTTATCCTCCTTGTTCATTTTATGAACGCATTCAAATTAATCCTGTCATTTGAAAAATACAATACATATAAACCCTAAAATGAACTTTTTATTCCACTTTTGTGATCTGTATCTGATTTTAAGGAAAAGCCGGTAGATTAATTAAGTTAAGGGAGTATTATCTAAGGAGTCTATTGAGTCATTTTAGGAGAATGCGATGAGTTACTTACTATCTAAATCCAAAAAAAATCATCCTGAAAAGAACGGTGAAGTCCAAAAAATCACACCGCAAACAGCCAATTGGGAATATGTCGGTTTTGAGATGTATCACCTGCAAAAAGACCAAGAGCTTACCTTCGATACGGAAAATACTGAGGTTTGCTTCGTGCTGATTGCTGGTCAAGCCACTGTTGCAACCGCTCAAGCCACA > 1/1808869‑1809359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |