| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,797,585 | G→A | intergenic (+15685/+37799) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,797,585 | 0 | G | A | 98.7% | 218.9 / NA | 77 | intergenic (+15685/+37799) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (47/29); minor base C (1/0); total (48/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTTTGGGTCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAGCAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTACGGAGTT > 1/1797341‑1797828 | ggTTTGGGTCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAatat > 1:737636/1‑251 (MQ=255) gTTTGGGTCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATg > 1:71999/1‑251 (MQ=255) tGGGTCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCaa < 1:308989/251‑1 (MQ=255) tCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATgg < 1:388419/250‑1 (MQ=255) cTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGCAAGCCATTCGCGATATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTa > 1:417003/1‑251 (MQ=255) cTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTa > 1:865652/1‑251 (MQ=255) cgccgcCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg < 1:321487/251‑1 (MQ=255) cgccgcCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg < 1:169161/251‑1 (MQ=255) ccgccATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCCTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTg < 1:177115/251‑1 (MQ=255) gccATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGc > 1:634513/1‑250 (MQ=255) aTTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGc < 1:347204/232‑1 (MQ=255) tCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCaa > 1:531556/1‑251 (MQ=255) tCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCaa > 1:411574/1‑251 (MQ=255) tCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCaa > 1:758982/1‑251 (MQ=255) gCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGatt > 1:868839/1‑250 (MQ=255) gAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCaa < 1:250906/204‑1 (MQ=255) aTTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCGCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATtcaattcaat < 1:280696/251‑1 (MQ=255) ggTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCa > 1:661825/1‑251 (MQ=255) aaaGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATggg < 1:177826/251‑1 (MQ=255) aaaGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATggg < 1:469555/251‑1 (MQ=255) aaGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGggc < 1:370935/251‑1 (MQ=255) gCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATATCGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGggcgg > 1:667369/1‑251 (MQ=255) aTCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAAt > 1:766823/1‑172 (MQ=255) gCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGattcaat > 1:783988/1‑204 (MQ=255) ccACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCaccgac < 1:362433/251‑1 (MQ=255) tCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAatat > 1:202570/1‑200 (MQ=255) gTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCAtgg > 1:98226/1‑249 (MQ=255) tATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAATGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCAtggtgg < 1:440151/251‑1 (MQ=255) ggTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACtt > 1:594130/1‑251 (MQ=255) gTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACtt < 1:291569/250‑1 (MQ=255) gtgtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg < 1:456018/142‑1 (MQ=255) gtgtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg > 1:441543/1‑142 (MQ=255) gtgtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATcc < 1:650697/192‑1 (MQ=255) gtgtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATc > 1:155246/1‑191 (MQ=255) gtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACaa < 1:744668/123‑1 (MQ=255) gtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg < 1:55315/140‑1 (MQ=255) gtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATcc > 1:834359/1‑190 (MQ=255) gtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCg > 1:185386/1‑251 (MQ=255) gtATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTAAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTc > 1:665547/1‑214 (MQ=255) ccTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGaaaaa > 1:841300/1‑251 (MQ=255) cACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATcc < 1:435155/166‑1 (MQ=255) cACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGCTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTa > 1:785897/1‑251 (MQ=255) aCGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTa > 1:280334/1‑250 (MQ=255) cGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCAtgg > 1:274717/1‑210 (MQ=255) cGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACg > 1:708099/1‑251 (MQ=255) ttAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGc < 1:720803/251‑1 (MQ=255) aGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGt < 1:396015/217‑1 (MQ=255) gTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGAc > 1:208821/1‑209 (MQ=255) gTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTAc < 1:80319/244‑1 (MQ=255) gggTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCa > 1:846808/2‑188 (MQ=255) gTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCAtgg > 1:129629/1‑189 (MQ=255) gTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAAc < 1:631645/250‑1 (MQ=255) aaaTTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCa > 1:503513/1‑240 (MQ=255) gcaacGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGt > 1:215150/2‑76 (MQ=255) caacGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTAc > 1:354176/1‑210 (MQ=255) acGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGc > 1:783586/1‑60 (MQ=255) acGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGt < 1:308740/184‑1 (MQ=255) acGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATgga > 1:482719/1‑249 (MQ=255) acGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTa > 1:500938/1‑251 (MQ=255) acGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTA‑GCAAACCGGAGAACCAATATGCAATGGTTTAAAGGGCCGCCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCATTCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGCCACCGTCACCGACCGTACCATGGGGGACTTAGGTTCCGTAGAAAAAATCCCCCACCAAATTACGGCCCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGagtaa > 1:694624/1‑247 (MQ=255) ggTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGggc > 1:236284/1‑118 (MQ=255) aaCATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAAc < 1:392154/251‑1 (MQ=255) aaCATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAAc < 1:894898/251‑1 (MQ=255) aCATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAatta > 1:404200/1‑215 (MQ=255) aCATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAAc > 1:80318/1‑250 (MQ=255) aCATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAAc > 1:656389/1‑250 (MQ=255) cATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAg > 1:261509/1‑47 (MQ=255) cATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAat > 1:566384/1‑212 (MQ=255) cATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAAc > 1:764511/1‑230 (MQ=255) aaaCGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACg > 1:866103/1‑251 (MQ=255) cGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGggcggc > 1:763394/1‑99 (MQ=255) cGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCAtgg > 1:690330/1‑136 (MQ=255) ggCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTa > 1:360711/1‑250 (MQ=255) gCAGA‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAAC‑GGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTAc < 1:524689/249‑1 (MQ=255) a‑CGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTACgg < 1:190190/248‑1 (MQ=255) cGGAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCCATTATTTGCCGCTGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTACGGAGtt > 1:844478/1‑251 (MQ=255) ggAGAAACAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGAGTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATGACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTAc < 1:883567/234‑1 (MQ=255) | GGTTTGGGTCACTCCGCCGCCATTCACACCTCCGATGCGGAGCTTGCCAAAGAATTTGGTAAACGGGTGAAAGCCATTCGCGTTATCTGGAACTCGCCTTCCACCTTCGGCGGTATCGGTGATGTGTATAACGCCTTCCTGCCTTCCCTCACGTTAGGTTGTGGTTCTTATGGTAAAAATTCCGTGGGCAACAACGTAAGTGCGGTCAATTTAATTAACATTAAACGAGTAGGCAGA‑CGGAGAAGCAATATGCAATGGTTTAAAGTGCCGTCAAAAATCTATTTTGAACGGGATTCAATTCAATATCTTCAATCCATGGGCGGCATGGAACGCGTGGTCATCGTCACCGACCGTACCATGGTGGACTTAGGTTTCGTAGAAAAAATCGCCCACCAAATTACGGCTCGTGGCAATCACGTAACCTACCAATTATTTGCCGATGTAGAACCGGATCCGTCCATTGAAACCGTACGCCGTGGTACGGAGTT > 1/1797341‑1797828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |