| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,761,428 | A→T | intergenic (+119070/‑20297) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,761,428 | 0 | A | T | 100.0% | 234.9 / NA | 81 | intergenic (+119070/‑20297) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (44/37); total (44/37) | |||||||||||
ACCGAAGACATTTGTCTGTTGCCATACCGGAGTGAAATCATGTTGCGTCGACAATTCTGTCTGACCGCGCTGCATAGAAATACTCACATTCGGCAAGGTTTCCTGTTGCTCAAAATCGTATTTAACGAATTCAGGGTTTTCCGGTGCAAAAGCATTGACCTCGTTCCCATTATTCATCGGCACATAAAACATATCCTGCGCTTTTGATAAGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACAAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCGGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATACGCCGAATTT > 1/1761185‑1761670 | aCCGAAGACATTTGTCTGTTGCCATACCGGAGTGAAATCATGTTGCGTCGACAATTCTGTCTGACCGCGCTGCATAGAAATACTCACATTCGGCAAGGTTTCCTGTTGCTCAAAATCGTATTTAACGAATTCAGGGTTTTCCGGTGCAAAAGCATTGACCTCGTTCCCATTATTCATCGGCACATAAAACATATCCTGCGCTTTTGATAAGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCg > 1:806159/1‑251 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ccTGCGCTTTTGATAAGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGccc < 1:165857/251‑1 (MQ=255) gcgcTTTTGATAAGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGc > 1:736060/1‑125 (MQ=255) aGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAAt > 1:215187/1‑250 (MQ=255) gCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATca > 1:164166/1‑251 (MQ=255) atgtgtaaaagagccagccGCAGGATTGACTAATCCCGTAAGCTGCTCCCCCGCTTCCTGCCCCGGATTTTCCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTCCCTCTCTTTCAGTTTCGTCGTTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCACCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACAAAAAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAAAAAACCCCACCGCCACAGAAATCACAg < 1:132433/234‑1 (MQ=255) cagtatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACaa > 1:626557/4‑240 (MQ=255) atatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAgc > 1:102415/1‑39 (MQ=255) atatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATaaaaaa < 1:215778/203‑1 (MQ=255) atatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAg > 1:413064/1‑251 (MQ=255) tatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCa < 1:264644/99‑1 (MQ=255) tatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTcagccag > 1:160196/1‑170 (MQ=255) tatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGt > 1:46537/1‑251 (MQ=255) tatTAATGCGATCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGt > 1:495189/1‑251 (MQ=255) aTGCGACCCGCGGAATTGACTATTTCCGTAAGCTCCCCCCCCGTTTCCGGCGCCGGATTTTCCCCAACCCCGATCTC‑TCCGGGGGTTTCTGCCTTGTGTGTTCCCTCTTTTTCATTTTCGTGGTTTTTTTCCGGTTTTTAAGGGGTTTTTTGAATGGCCAGCCAGGGGTAAAATTTCATAAATAGACAAAAAAAAACCGCCCCAGAAAAAAAAAAAAACCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGa < 1:385443/251‑1 (MQ=255) cGATCCGCAGGATTGTCTATTCCCGCAGGCTGCTCCCCCTCTCCCTGCGCGGGATTTTCCCCATTCCCGTTCTCTTCGGGCGT‑TTTTGCAGTGTGCTTTTCCTCTTTTTCATTTTCGTCGTTTTTTTCCAGTTCTTCGGGCGGATTTTGCATGGTTAGCCAGGGGTAAATTTTAATAAAAAGACGAAAAAAAAACGCGCCCAAAAAAAAAATAAGGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATa < 1:212200/250‑1 (MQ=255) aTCCGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGa > 1:183907/1‑246 (MQ=255) ccGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGc < 1:253379/220‑1 (MQ=255) ccGCAGGATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATACGcc > 1:551943/1‑250 (MQ=255) 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ggATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATACGCCGAAttt > 1:797776/1‑251 (MQ=255) ggATTGACTAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCAGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATACGCCGAAttt > 1:393817/1‑251 (MQ=255) | ACCGAAGACATTTGTCTGTTGCCATACCGGAGTGAAATCATGTTGCGTCGACAATTCTGTCTGACCGCGCTGCATAGAAATACTCACATTCGGCAAGGTTTCCTGTTGCTCAAAATCGTATTTAACGAATTCAGGGTTTTCCGGTGCAAAAGCATTGACCTCGTTCCCATTATTCATCGGCACATAAAACATATCCTGCGCTTTTGATAAGCCGGAAATATTAATGCGATCCGCAGGATTGACAAATTCCGTAAGCTGCTCCACCGCTTCCTGCGCCGGAGTTTTCCCAATCACGATCTCTTCCGGCGG‑TTCTGCCATGTGCGTTTCCTCACTTTCAGTTTCGTCGGTTTTTTCCGGGTCTTCAGGCGGATTTTGCATGGTCAGCCAGCGGTAGAATTTCATTAATAGACGAATAAAAAACGCGCCCGAACAGAAAATAAAGCCCACCGCCACAAAAATCACAGCCAGTAAGGATACGCCGAATTT > 1/1761185‑1761670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |