| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 11,010 | G→A | intergenic (+6403/+119495) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 11,010 | 0 | G | A | 100.0% | 237.8 / NA | 82 | intergenic (+6403/+119495) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (43/39); total (43/39) | |||||||||||
GATTTGTGTAGTCTCCTGACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGGAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTT > 1/10776‑11254 | gATTTGTGTAGTCTCCTGACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATg > 1:84926/1‑251 (MQ=255) gtgtAGTCTCCTGACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAgg > 1:305788/1‑251 (MQ=255) ctcCTGACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAaata > 1:871145/1‑251 (MQ=255) gACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACa > 1:276008/1‑251 (MQ=255) gACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACa > 1:415325/1‑251 (MQ=255) aaaCAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAg > 1:78799/1‑251 (MQ=255) aaCAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCAT‑AAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGaa < 1:127517/251‑1 (MQ=255) tCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAaat < 1:831793/233‑1 (MQ=255) tCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGa > 1:11701/1‑251 (MQ=255) ttCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAg < 1:765160/245‑1 (MQ=255) tCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGc > 1:775997/1‑224 (MQ=255) ctactaCCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGc < 1:819290/251‑1 (MQ=255) cACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCTATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAg < 1:433412/234‑1 (MQ=255) cATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGAc < 1:810496/251‑1 (MQ=255) aTTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGgtt < 1:623499/251‑1 (MQ=255) aTTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGAACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGAAAGGCAAAATAATACAAATAGAAAGGGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGAACAGgtt > 1:800047/1‑251 (MQ=255) aaaaCGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGgttagtta < 1:662046/251‑1 (MQ=255) gCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTaa > 1:479212/1‑251 (MQ=255) aTTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAat > 1:296618/1‑251 (MQ=255) ttGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGAc > 1:718932/1‑230 (MQ=255) ttGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATAtt > 1:483193/1‑251 (MQ=255) gTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGa > 1:196008/1‑251 (MQ=255) aCATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATAc > 1:579946/1‑189 (MQ=255) tAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAg > 1:797302/1‑251 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:672264/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:627884/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:226981/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:672948/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:521742/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:515152/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:508089/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:474588/251‑1 (MQ=255) cAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:408182/251‑1 (MQ=255) cAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATacac < 1:17747/249‑1 (MQ=255) aTTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGgttagtt < 1:496962/169‑1 (MQ=255) aTTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATacac < 1:460669/247‑1 (MQ=255) aTTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAAt > 1:518628/1‑251 (MQ=255) ttAATAAATTAGTAATGTACTGGCAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAg > 1:199831/1‑152 (MQ=255) taaATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTa > 1:160778/1‑208 (MQ=255) aaTTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTgag > 1:794574/1‑91 (MQ=255) aaTTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCgg > 1:825119/1‑251 (MQ=255) aTTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAat < 1:299634/169‑1 (MQ=255) ttAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGAc < 1:531658/150‑1 (MQ=255) gTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAGGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGAATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTa > 1:314295/1‑251 (MQ=255) gTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:172864/184‑1 (MQ=255) gTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:336791/184‑1 (MQ=255) gTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTa > 1:373538/1‑251 (MQ=255) gTAATGTACTGACAGAACACGGCACC‑TTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACCAAGGACATTGGAAGCTGAGAAAACGATGTAAGGCCCAATAATACCAATAGAAAGGGATCTGCCCCCCCAAAAAGGTGGAAAGGTTAGTTAACTTAAATAATTAGCTCAGGATTGTATCCGGCCCAATCCTTTTAAATTGGTTTAATTTGGTTTTTGTTGTAATAAACAAATTTAACCGGCCCTaa > 1:702572/1‑251 (MQ=255) aaTGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCaaaa > 1:624158/1‑137 (MQ=255) aaTGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAAt < 1:717323/251‑1 (MQ=255) tGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGgttagtta > 1:722637/1‑153 (MQ=255) tGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATcc < 1:686631/251‑1 (MQ=255) gTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGc < 1:375204/96‑1 (MQ=255) aCTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt < 1:619/177‑1 (MQ=255) gACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGc > 1:594103/1‑179 (MQ=255) gACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAATACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATc < 1:714097/244‑1 (MQ=255) gAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGa > 1:631398/1‑251 (MQ=255) acacGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATc > 1:315059/1‑110 (MQ=255) acacGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGata > 1:265093/1‑251 (MQ=255) acGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGataat < 1:629750/251‑1 (MQ=255) cACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATaaa < 1:9820/250‑1 (MQ=255) aCCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAg < 1:62075/251‑1 (MQ=255) aCCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAg < 1:290968/251‑1 (MQ=255) ccTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt > 1:388861/1‑160 (MQ=255) ccTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt > 1:455597/1‑160 (MQ=255) ccTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTAccc > 1:35470/1‑220 (MQ=255) gaaTGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAatat < 1:621611/118‑1 (MQ=255) gaaTGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTg > 1:326658/1‑251 (MQ=255) tCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTgcagca < 1:26732/251‑1 (MQ=255) gtgCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCa > 1:806670/1‑251 (MQ=255) gCCACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCAtt > 1:795144/1‑251 (MQ=255) ccACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCAttt > 1:735023/1‑251 (MQ=255) cACTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTa < 1:64197/251‑1 (MQ=255) aCTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTAt > 1:370892/1‑120 (MQ=255) aCTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTaa > 1:880602/1‑251 (MQ=255) aCTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTaa > 1:68285/1‑251 (MQ=255) cTAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTgcag < 1:246436/238‑1 (MQ=255) tAAGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAgg > 1:581738/1‑251 (MQ=255) aaGTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAgg > 1:307623/1‑250 (MQ=255) gTACATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAata < 1:681843/97‑1 (MQ=255) cATTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCAtatt > 1:754289/1‑248 (MQ=255) aTTGGAAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGTCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTc < 1:572819/218‑1 (MQ=255) | GATTTGTGTAGTCTCCTGACATAAACAAATCCTTCTACTACCTCACCGGAAGCATCGATTCTAAAACGGCATTTTGTTACATAGCGGAACAATTAAAAAAACACTTCCATAAAAAAGCAAGTGAAGAACAAATTTTCTAAGCAATTTAATAAATTAGTAATGTACTGACAGAACACGGCACCTTTAATTTTATTTTTCTAACGAAGAATGTCGCTGTGCCACTAAGTACATTGGGAGCTGAGAAAGCGATGTAAGGCCAAATAATACAAATAGAAAGTGATCTGCCCCCCCAAAAAGTTGGACAGGTTAGTTAACTTAAATATTGAGCTCAGTATTGTATCGGGCTCAATCCTTTTAAATCGGTTTAATTCGTTTTTGGTTGTAATACACAAATTTACCCGGCTCTAATCCTGCCTGTTGATAATAAAAGGTTGAATGAGGCATTTCAGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTT > 1/10776‑11254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |