| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,674,354 | A→C | intergenic (+31996/‑107371) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,674,354 | 0 | A | C | 100.0% | 243.7 / NA | 81 | intergenic (+31996/‑107371) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (46/35); total (46/35) | |||||||||||
CCGCCCCCACTTCAAAACAGTGTTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAAATAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTTGT > 1/1674114‑1674596 | ccgccCCCACTTCAAAACAGTGTTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTc < 1:414925/249‑1 (MQ=255) cccccACTTCAAAACAGTGTTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCt > 1:146628/1‑250 (MQ=255) cTTCAAAACAGTGTTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAg > 1:582825/1‑251 (MQ=255) gtgtTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTc < 1:469368/230‑1 (MQ=255) agCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGtt < 1:671336/249‑1 (MQ=255) gCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGa > 1:718612/1‑251 (MQ=255) cTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGaa > 1:201889/1‑250 (MQ=255) cTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAAc < 1:678097/251‑1 (MQ=255) cTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAAc < 1:761735/251‑1 (MQ=255) cGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATTGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt < 1:446857/251‑1 (MQ=255) cGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt > 1:816885/1‑251 (MQ=255) atatAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt > 1:795854/1‑239 (MQ=255) gCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg > 1:744312/1‑251 (MQ=255) cGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg < 1:33274/250‑1 (MQ=255) cGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg < 1:285219/250‑1 (MQ=255) cGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg < 1:268013/250‑1 (MQ=255) cGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg < 1:748904/250‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAg < 1:761667/230‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAAt > 1:620251/1‑240 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCa > 1:853237/1‑251 (MQ=255) tAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGt < 1:63086/251‑1 (MQ=255) gCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGtt > 1:408737/1‑251 (MQ=255) gACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt < 1:746496/200‑1 (MQ=255) gACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg > 1:683573/1‑217 (MQ=255) aCTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCaaa < 1:716930/148‑1 (MQ=255) aCTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTaa < 1:773955/242‑1 (MQ=255) aCTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGaa > 1:477354/1‑250 (MQ=255) aCTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGaa > 1:232133/1‑250 (MQ=255) aTGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGt > 1:80547/1‑251 (MQ=255) tGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGtt > 1:48148/1‑251 (MQ=255) aCTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTa > 1:898317/1‑250 (MQ=255) cTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACg > 1:345479/1‑171 (MQ=255) cTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt > 1:787236/1‑188 (MQ=255) tATCTATTCAAAAACGATCCTAATTCCCTAAGTCCCGGTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAac < 1:479763/236‑1 (MQ=255) tATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGc > 1:336463/1‑123 (MQ=255) aTCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCg > 1:299862/1‑250 (MQ=255) ataCAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGttt > 1:274114/1‑154 (MQ=255) aaaaTCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATc < 1:508271/251‑1 (MQ=255) aTCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGa > 1:570572/1‑251 (MQ=255) aTCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCaa > 1:668410/1‑251 (MQ=255) tCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAAc < 1:274618/161‑1 (MQ=255) tCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTg > 1:317239/1‑245 (MQ=255) tCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAAt > 1:519557/1‑251 (MQ=255) tCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAAt > 1:204572/1‑251 (MQ=255) ccTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATc > 1:302145/1‑242 (MQ=255) ttCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAAt < 1:181905/161‑1 (MQ=255) ttCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGt > 1:323255/1‑197 (MQ=255) ttCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGt > 1:5326/1‑251 (MQ=255) tCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAg > 1:593015/1‑140 (MQ=255) ccTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg > 1:203093/1‑176 (MQ=255) aTGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAACAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTa < 1:435477/251‑1 (MQ=255) aCGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAggg > 1:777171/1‑167 (MQ=255) cGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCTCTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTAATCTATGTAcc < 1:61006/251‑1 (MQ=255) cGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTAc < 1:276703/250‑1 (MQ=255) ttCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCAt < 1:792518/251‑1 (MQ=255) cAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGtt > 1:203330/1‑236 (MQ=255) cAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTg > 1:494471/1‑251 (MQ=255) aCATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATc < 1:88640/211‑1 (MQ=255) cATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGttttt > 1:59314/1‑250 (MQ=255) aTGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGaaa < 1:333037/143‑1 (MQ=255) aTGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCg < 1:240036/251‑1 (MQ=255) ggAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATCTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTa > 1:552393/1‑251 (MQ=255) aaGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTAtt > 1:460413/1‑250 (MQ=255) cATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCgg < 1:53952/251‑1 (MQ=255) gAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCAt > 1:509095/1‑223 (MQ=255) gAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGagaaga > 1:325015/1‑251 (MQ=255) ccTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAg < 1:181724/127‑1 (MQ=255) gAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTtg > 1:256117/1‑251 (MQ=255) gAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTtg > 1:119994/1‑251 (MQ=255) aTAAACAGCTGTTTTTTGGGTGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTAc < 1:677734/112‑1 (MQ=255) aaaCAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTgg > 1:602562/1‑250 (MQ=255) gCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAg > 1:302860/1‑52 (MQ=255) gCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCAt < 1:896647/204‑1 (MQ=255) gTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCCCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGCTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAg > 1:675596/1‑249 (MQ=255) tGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTc < 1:9450/251‑1 (MQ=255) tGGGCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTc < 1:248015/251‑1 (MQ=255) gggCGTACTTTGTGAATAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTAcc > 1:872109/1‑192 (MQ=255) aaTAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTATTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTtg < 1:428528/250‑1 (MQ=255) aaTAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTtgt > 1:894112/1‑251 (MQ=255) aaTAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTtgt < 1:559466/251‑1 (MQ=255) aaTAAAAACTAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTtg < 1:758453/250‑1 (MQ=255) | CCGCCCCCACTTCAAAACAGTGTTTGATTCCTTGGAAATTGAAGGTAGAGCCTATTACGTTTTAGCAAAATATAGCGATACCTTTATTTTAGCTAAAAGCATTCACGCGACTAATGGTAACTTTTATCTATACAAAATCGATCCTAATTCCTTATGTCACGTTCAAGTAATCAACATGGAAAGCATACCGAAACAACCTGAATAAACAGCTGTTTTTTGGGCGTACTTTGTGAATAAAAAATAATGCTCCGCTCAAAAAGTGCGGTGAAAAAAACCAACGTTTTTTAGACGTTGGTTTGAACAAAAATAGTACTGAAAATAAGGGAAATCACTTTGTTATTAGTTTGTTAATTTCAGAACACGTTTTTACGACCGCACTTTATCTGAGCAATTCCGGTTATCTATGTACCATTGCACGGTTTTTCGTATTCCGGAGAAGAAATTTTCTTGTGGCTGCCAGCTTAATTCTTGTTGAATTTTTGT > 1/1674114‑1674596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |