| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,648,223 | T→C | intergenic (+5865/‑133502) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,648,223 | 0 | T | C | 100.0% | 202.6 / NA | 70 | intergenic (+5865/‑133502) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (39/31); total (39/31) | |||||||||||
CTAAGAACGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTTCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCACCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCAATAGTTAAGACTTTTCCCTGCACCCCTATCATGGCATGATCC > 1/1647980‑1648467 | cTAAGAACGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGa < 1:79815/250‑1 (MQ=255) aaGAACGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATgg < 1:30253/251‑1 (MQ=255) gAACGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGgcg > 1:89863/1‑251 (MQ=255) aaCGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGgcg > 1:419191/1‑250 (MQ=255) cAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAAc < 1:254281/251‑1 (MQ=255) aaaTAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACt < 1:67144/251‑1 (MQ=255) tttCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGAt > 1:720167/1‑251 (MQ=255) aaaCAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGa < 1:527094/251‑1 (MQ=255) aaCAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGAt < 1:387125/251‑1 (MQ=255) cagGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGAtg < 1:542702/247‑1 (MQ=255) cagGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGc < 1:663233/250‑1 (MQ=255) aaGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGaaa < 1:11475/250‑1 (MQ=255) gCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGa > 1:67758/1‑232 (MQ=255) ccATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAAc > 1:38988/1‑222 (MQ=255) ccATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAAtt < 1:572749/251‑1 (MQ=255) caccaAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATg > 1:68745/1‑251 (MQ=255) ccaAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGaaa > 1:416199/1‑239 (MQ=255) ggggATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGAt > 1:826778/1‑196 (MQ=255) ggATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCAttt > 1:325393/1‑250 (MQ=255) ggATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCAttt > 1:280184/1‑250 (MQ=255) ggATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCAttt > 1:400690/1‑250 (MQ=255) gACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGAtg < 1:743584/219‑1 (MQ=255) aaGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTaa > 1:228131/1‑251 (MQ=255) aaGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTaa > 1:653295/1‑251 (MQ=255) aGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAAtt < 1:770801/227‑1 (MQ=255) aGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTaaa > 1:96836/1‑251 (MQ=255) aGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTaaa > 1:682784/1‑251 (MQ=255) aGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTaaa > 1:333738/1‑251 (MQ=255) aaTCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAAtttt > 1:349833/1‑251 (MQ=255) aaTCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAAtttt > 1:595871/1‑251 (MQ=255) ttaaATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGc < 1:70939/251‑1 (MQ=255) aatttaatttCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAaaca > 1:118183/1‑251 (MQ=255) aaTGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAAc > 1:92608/1‑224 (MQ=255) tGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTg < 1:625206/251‑1 (MQ=255) gCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTg > 1:592693/1‑250 (MQ=255) ccTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGc < 1:488587/250‑1 (MQ=255) cTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAAc < 1:201083/219‑1 (MQ=255) cTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTa > 1:82263/1‑251 (MQ=255) ggCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCa > 1:299402/1‑251 (MQ=255) gCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAAt < 1:877410/248‑1 (MQ=255) gCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAAt > 1:778156/1‑243 (MQ=255) gCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGccc > 1:343781/1‑250 (MQ=255) gCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGccc > 1:141586/1‑250 (MQ=255) gCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGccc > 1:730339/1‑250 (MQ=255) cACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCt < 1:17026/251‑1 (MQ=255) aCTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGccc > 1:524233/1‑248 (MQ=255) tAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAAt > 1:611198/1‑238 (MQ=255) tAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGAt < 1:639752/251‑1 (MQ=255) tAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGAt < 1:175762/251‑1 (MQ=255) aTTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGAtt > 1:161093/1‑250 (MQ=255) cTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCAt < 1:879821/219‑1 (MQ=255) aTTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAg < 1:765869/250‑1 (MQ=255) aaTGTATACTAATCCCGAACAGTGGTATCCGCCTCTGCTTGATGAGATTCTTGTGCAATACGTCCCACGATGGCGCTGTTTTAACTTTGTTGATTAGGTTGTTCAGAAATTATTAATTGCTTCATTTCGTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCATCAATATCATTCCCTGCTAAATCACGCCCCTGGAt < 1:460110/217‑1 (MQ=255) aaTGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACgtag > 1:286227/1‑228 (MQ=255) aTGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCaa < 1:44993/251‑1 (MQ=255) ataCAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGcc > 1:361797/1‑205 (MQ=255) ataCAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGc < 1:698408/250‑1 (MQ=255) ataCAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGc > 1:616620/1‑250 (MQ=255) taCAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGc < 1:80261/203‑1 (MQ=255) aTCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTc > 1:384541/1‑183 (MQ=255) gAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCaa > 1:781496/1‑251 (MQ=255) aCAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATc > 1:638800/1‑187 (MQ=255) cAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTAt < 1:471334/212‑1 (MQ=255) ttCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCAATAGTTAAGAc < 1:55444/251‑1 (MQ=255) gCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGAt < 1:202846/169‑1 (MQ=255) gCTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTAt > 1:822516/1‑183 (MQ=255) cTTTTACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAAt < 1:343418/69‑1 (MQ=255) tttACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCAATAGTTAAGACTTTTCCCTGCACCCCTATCATAGCa > 1:337210/1‑251 (MQ=255) ttACAATACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTAt > 1:534766/1‑179 (MQ=255) aTACGTCCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCATCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCAATAGTTAAGACTTTTCCCTGCACCCCTATCATAGCATGATcc < 1:193095/251‑1 (MQ=255) | CTAAGAACGCGATCCAAATAACCTTTCAAAACAGCAGGGAAGCCCATCCACCAAAGGGGATAGACCAAGGTAATCAAATCCGCTTCTTTAATTAAATTTTGCTCAAATTTAATTTCTGCCGGCACAATGCCTTCAGGCCCTGCACTTAATTCACTCCAAGACAAAACGGGATTGAAATTTAATGTATACAAATCCCGAACAGTGGTTTCCGCCTCTAATTCATGAGAGGCTTTTACAATACGTTCCACGATGGCGCGGTTAAAACTTTGTTGATTAGGATGTGCAGAAATAATTAAATGCTTCATTTCTTTCCTTAAATTTTCTTAACTTTCAATGTGATGCTATCAACAGAAACAACTTCAACAATATCATTCACTGCTAAATCACGCCCCTGGATTCTCCACGTAGTATCACCGAAAGCGCCTCTACCAATGCCGTTTTCGGCAATAGTTAAGACTTTTCCCTGCACCCCTATCATGGCATGATCC > 1/1647980‑1648467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |