| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,646,025 | T→C | intergenic (+3667/‑135700) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,646,025 | 0 | T | C | 100.0% | 163.7 / NA | 57 | intergenic (+3667/‑135700) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (26/31); total (26/31) | |||||||||||
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GTTAAGCCCAGCAATTGCACCGGCACATTTAACGAAGCGATGTTCATTGCCACGTTTGCCGCACCGCCTGCACGCTCCTCATTTTGCTGAACACGCACCACCGGCACCGGTGCTTCCGGTGAAATACGGTTGGTTGCACCGAACCAATAGCGATCCAACATCACATCGCCTAATACCAAAACTTTTGCATGATTAAATTGTGCAGAATATTGAGCCATTTGATTTTCTCTTATATAGAATAAAAAATTTCGCTAATACTACCACAGGGGAAATGCTATTTCCTAAAAATTCCGCTAAACTAAACCAATTGAAATAATCCTGTAATTCCTTTATGGCAAAATCCGTTCTTCCGACTTTTAAAACTGAATTTCTCCATCCCAAACATTGGGGCTTTTGGCTTGCACTCGGCATTTTCCGTCTGATATTACTGCTTCCTTATCCTATTTTATGCAAAATCGGACACGGATTAGGTTGGTTATTTG > 1/1645786‑1646267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |