| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,419,349 | T→C | intergenic (‑1098/‑72186) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,419,349 | 0 | T | C | 100.0% | 226.5 / NA | 75 | intergenic (‑1098/‑72186) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Ser‑GGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/37); total (38/37) | |||||||||||
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aCCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCGAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGaaa > 1:425147/1‑251 (MQ=255) aTGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTa < 1:444307/152‑1 (MQ=255) aTGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGAt > 1:821243/1‑219 (MQ=255) gATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGc < 1:640029/192‑1 (MQ=255) 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aaaaaaaGAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAg < 1:42610/251‑1 (MQ=255) gAATTGTGGGTTTTGCTTGAATGCCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAGTTCTTgg > 1:665580/1‑251 (MQ=255) gggTTTTGCTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTTACAt > 1:625848/1‑99 (MQ=255) | ACACAACGGTGCTTGCCGTATTACAGGCGATGACAATAAGATCCAACGGATACATTTGATCTATGCGTTGGCAGATTTTTAACGTACGTTCGATGATCTTTTCTTCAGGCTTCTCGGAATAAGGAAAGTAAGCGTTATCAAAGCAATACAAATAGTGATAGTCAGGCAAAAGTTGCTTAACCTCATGATAAACACTAAAGCCGCCGACGCCGGAATCAAAAAAAAGAATTGTGGGTTTTGTTTGAATGTCCATAATCAGTTTGATGGAAAAATTTGCGTCATTTTATTCGCTTATAAGGCGGTTCTCAAGGAAAAGCTCGCTGATTAACATCGGTATGTTTTGGACCCAAAACAAGGAACGACGGGCATATAATCCGCTTTGAGGATCTTGCGCCCATTGGATTAACCGCCTTTGTGGCGTTTGCTGAAATAGCCATTCGCCGATAGGTTTTTTGCCTAACATTGACAGTTCTTGG > 1/1419109‑1419584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |