| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,410,536 | G→T | intergenic (‑17149/+2769) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,410,536 | 0 | G | T | 100.0% | 159.6 / NA | 54 | intergenic (‑17149/+2769) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (27/27); total (27/27) | |||||||||||
GATAAAGACTTACCTTTATCTAACTGTGCTTGGATTGCTTTCGGTGTTCTGCCTTGACCTGTCCAAGTTTTCGTTACGCCCTTTTCATCAACATATTGATATTTTGCAGGACGAGTATCTCTTTTCTTACGAACCGCATCAGAACCTAAAATCTCTGCTAATTCGTCTGCAGTGATACCTTCTTGCTTTAATAATTCTTTATATTTGGCAATACGTTCTTGTCGCTCGTTTTCTTCTTGCTGAGCCTTTAAAATCTCTTCTTTCTTTTCCGTAACGACTAATTGCAATTTTTCCAAAATACTTTCAAGCTGTTCTAATGCTAAATCACGCGCGACCATACGCAAGCTACGAATATTCGTTAATATTTTTAATACATCGGACATTAAATTTTCTCCTCTAGACACAATTAAATTAATATACACGAAGCTAGGCTAGCATAAACAAATTACCCACATAGGTAAATAC > 1/1410316‑1410780 | gaTAAAGACTTACCTTTATCTAATTGTGCTTGGATTGCTTTCGGTGTTCTGCCTTGACCTGTCCAAGTTTTCGTTACGCCCTTTTCATCAACATATTGATATTTTGCAGGACGAGTATCTCTTTTCTTACGAACCGCATCAGAACCTAAAATCTCTGCTAATTCGTCTGCAGTGATACCTTCTTGCTTTAATAATTCTTTATATTTGGCAATACGTTCTTTTCGCTCGTTTTCTTCTTGCTGAGCCTTTaa > 1:808591/1‑251 (MQ=255) 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GATAAAGACTTACCTTTATCTAACTGTGCTTGGATTGCTTTCGGTGTTCTGCCTTGACCTGTCCAAGTTTTCGTTACGCCCTTTTCATCAACATATTGATATTTTGCAGGACGAGTATCTCTTTTCTTACGAACCGCATCAGAACCTAAAATCTCTGCTAATTCGTCTGCAGTGATACCTTCTTGCTTTAATAATTCTTTATATTTGGCAATACGTTCTTGTCGCTCGTTTTCTTCTTGCTGAGCCTTTAAAATCTCTTCTTTCTTTTCCGTAACGACTAATTGCAATTTTTCCAAAATACTTTCAAGCTGTTCTAATGCTAAATCACGCGCGACCATACGCAAGCTACGAATATTCGTTAATATTTTTAATACATCGGACATTAAATTTTCTCCTCTAGACACAATTAAATTAATATACACGAAGCTAGGCTAGCATAAACAAATTACCCACATAGGTAAATAC > 1/1410316‑1410780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |