| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,366,707 | C→T | intergenic (+227577/+26604) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,366,707 | 0 | C | T | 100.0% | 175.8 / NA | 61 | intergenic (+227577/+26604) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/33); total (28/33) | |||||||||||
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ttttACAAAAAATTTATCCATACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCGCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGGCGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTaa < 1:679526/251‑1 (MQ=255) ccAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGAt < 1:199008/251‑1 (MQ=255) tATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGgcg > 1:616519/1‑249 (MQ=255) aGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAgg < 1:67407/141‑1 (MQ=255) | CCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCACTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGGCG > 1/1366461‑1366943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |