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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) caaattctcttaacttattgctAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTc < 1:62677/230‑1 (MQ=255) ggTGGGATTGGAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTccc > 1:216026/1‑250 (MQ=255) gTGGGATTGGAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCa > 1:472675/1‑250 (MQ=255) 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gATTGGAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCggg > 1:782948/1‑250 (MQ=255) gATTGGAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCgg < 1:320447/250‑1 (MQ=255) gAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGc < 1:93502/250‑1 (MQ=255) 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cATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAg < 1:681317/251‑1 (MQ=255) gggTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGAt > 1:720965/1‑128 (MQ=255) ggTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTTGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAGtttg > 1:760869/1‑249 (MQ=255) ggTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAg > 1:880005/1‑247 (MQ=255) 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caggggTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTATCGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAGTTGGCACTCATGCCGCAAGCGAAGGATTGATGTTGGTTAGCaa < 1:526737/248‑1 (MQ=255) gggTGATGCTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAAACCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGGATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAGTTGGCACTCATGCCGCAAGCGAAGGATTGATGTTGGTTAGCAATaaa > 1:849434/1‑250 (MQ=255) cTGAAATATCTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAGTTGGCACTCATGCCGCAAGCGAAGGATTGATGTTGGTTAGCAATAAGTTAagag < 1:66177/250‑1 (MQ=255) 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CATTGGTACAGGCAGCGGCGTGTTAATGGCGAAAACAATGAACAAATTCAGCAAAACCAAAATTAATCCGCTTATCGGCTCCGCCGGAGTGTCCGCCGTGCCAATGGCAGCGCGCGTCTCCAACAAGGTGGGATTGGAAGCGGATAACCAAAACTTCCTGCTCATGCACGCCATGGGTCCGAATGTTGCCGGTGTTATCGGCTCCGCCATTGCCGCCGGGGTGATGCTGAAATATGTGGGCGCAATGTTGTAACGGTAAAAACGTTGCGAAAACCGACCGCACTTTTTAATGAATATAAGATGGTGCACGTTTCACCGGCGTGTACCTTTTCTTTCGCGAGAATCTATTTAAAAACCCACCGCACTTTTACTTCCCACCGGTATGCTTTAATTCTTCTTTTACCCGACATACAAACCAAAAGTTGGCACTCATGCCGCAAGCGAAGGATTGATGTTGGTTAGCAATAAGTTAAGAGAAT > 1/1344740‑1345218 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |