| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,279,797 | A→G | intergenic (+140667/+113514) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,279,797 | 0 | A | G | 100.0% | 153.8 / NA | 51 | intergenic (+140667/+113514) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/20); total (31/20) | |||||||||||
ATGCAAACCTTGCTCATTGACTATCGTGAACATCAACGTCCGATTAATTTGAGTATGGTATTAAAACAACAACTGGAAAGCTATCCGCTGTCACAACATTTTGATGTGGCGCGAATTATCGTGGATCAGGCGGTACGTCTGGGTATGGCAAGCGATGATTTAAGCGGTATTTATCCGATTTGGGAAAGCATTAACAAACGCGGCGCAGAAGTCCAGGCGAACGTCATTGATGAATATAAAAGCTAAAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATCGCGTTTTTAAAT > 1/1279552‑1280036 | atGCAAACCTTGCTCATTGACTATCGTGAACATCAACGTCCGATTAATTTGAGTATGGTATTAAAACAACAACTGGAAAGCTATCCGCTGTCACAACATTTTGATGTGGCGCGAATTATCGTGGATCAGGCGGTACGTCTGGGTATGGCAAGCGATGATTTAAGCGGTATTTATCCGATTTGGGAAAGCATTAACAAACGCGGCGCAGAAGTCCAGGCGAACGTCATTGATGAATATAAAAGCTAGAGTg > 1:618797/1‑250 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tCATTGATGAATATAAAAGCTAGAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATcg > 1:686071/1‑251 (MQ=255) atatAAAAGCTAGAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACtt < 1:306911/82‑1 (MQ=255) atatAAAAGCTAGAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAAtt > 1:205534/1‑176 (MQ=255) tataAAAGCTAGAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATCGCGTTTTTAAAt > 1:892160/1‑251 (MQ=255) | ATGCAAACCTTGCTCATTGACTATCGTGAACATCAACGTCCGATTAATTTGAGTATGGTATTAAAACAACAACTGGAAAGCTATCCGCTGTCACAACATTTTGATGTGGCGCGAATTATCGTGGATCAGGCGGTACGTCTGGGTATGGCAAGCGATGATTTAAGCGGTATTTATCCGATTTGGGAAAGCATTAACAAACGCGGCGCAGAAGTCCAGGCGAACGTCATTGATGAATATAAAAGCTAAAGTGCGGTCGTTTTTTCAGGTGTTTTTATGAACGACAAAACACTTAAAATTTTATTCACAATCTCACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATCGCGTTTTTAAAT > 1/1279552‑1280036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |