| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,276,560 | A→G | intergenic (+137430/+116751) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,276,560 | 0 | A | G | 100.0% | 183.6 / NA | 60 | intergenic (+137430/+116751) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/23); total (37/23) | |||||||||||
GGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGATTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATCAGTGCAACTGCTTTATTTGCTCTTTTCTTGACTGCTTGTGATAAACCGGTAGACAAAGCGCCGGATGCAAAACCGGAAGCGGCAGCCCAAACACAATCAGCACCGGCGACTGC > 1/1276318‑1276787 | ggtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGaa > 1:197221/1‑250 (MQ=255) 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gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATaatttaattt > 1:56848/1‑226 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCt > 1:611313/1‑233 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGt < 1:112331/244‑1 (MQ=255) 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GGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGATTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATCAGTGCAACTGCTTTATTTGCTCTTTTCTTGACTGCTTGTGATAAACCGGTAGACAAAGCGCCGGATGCAAAACCGGAAGCGGCAGCCCAAACACAATCAGCACCGGCGACTGC > 1/1276318‑1276787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |