| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,268,965 | C→A | intergenic (+129835/+124346) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,268,965 | 0 | C | A | 100.0% | 176.1 / NA | 61 | intergenic (+129835/+124346) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (37/24); total (37/24) | |||||||||||
TGGCGACTGCGTTAGGGCGCGAAACACCGGATTTTAATCACCATGCGGCGTTGTTTAACGACATTGCGCAAACGTCGAGTTTGCAGCGGGTGAAATTAATCAGTGAGCCTTGGGACATCGGACATTATGGCTATCAATTAGGCAATTTTCCCCATTATTTCGCTGAATGGAACGACCGTTTTCGTGATGATATGTGCCGTTTCTGGTTGTGGAAAAGTGGGGAAGTGGGCGCCTTTGCCGAACGTCTGGCGGGCTCCGGCGACATTTTTAAACAGGAACGGCGCCTGCCGCATACGTCGCTGAATTTTATTACCGCTCATGATGGCTTCACCTTGCGCGATTTAACCAGTTATAACCAAAAACACAATGAAGCCAATGGCGAAGAAAACCGTGACGGGCGCAATGAAAATTACAGTTATAACCATGGCTTTGAAGGCAGCGAATTGGATTTAACCGATCCGCACCAAAGTGCGGTAGAAAATCA > 1/1268727‑1269210 | tGGCGACTGCGTTAGGGCGCGAAACACCGGATTTTAATCACCATGCGGCGTTGTTTAACGACATTGCGCAAACGTCGAGTTTGCAGCGGGTGAAATTAATCAGTGAGCCTTGGGACATCGGACATTATGGCTATCAATTAGGCAATTTTCCCCATTATTTCGCTGAATGGAACGACCGTTTTCGTGATGATATGTGCCGTTTCTGGTTGTGGAAAAGTGGGGAAGTGGGCGCCTTTGCAGAACGTCTGGCg < 1:792495/251‑1 (MQ=255) 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TGGCGACTGCGTTAGGGCGCGAAACACCGGATTTTAATCACCATGCGGCGTTGTTTAACGACATTGCGCAAACGTCGAGTTTGCAGCGGGTGAAATTAATCAGTGAGCCTTGGGACATCGGACATTATGGCTATCAATTAGGCAATTTTCCCCATTATTTCGCTGAATGGAACGACCGTTTTCGTGATGATATGTGCCGTTTCTGGTTGTGGAAAAGTGGGGAAGTGGGCGCCTTTGCCGAACGTCTGGCGGGCTCCGGCGACATTTTTAAACAGGAACGGCGCCTGCCGCATACGTCGCTGAATTTTATTACCGCTCATGATGGCTTCACCTTGCGCGATTTAACCAGTTATAACCAAAAACACAATGAAGCCAATGGCGAAGAAAACCGTGACGGGCGCAATGAAAATTACAGTTATAACCATGGCTTTGAAGGCAGCGAATTGGATTTAACCGATCCGCACCAAAGTGCGGTAGAAAATCA > 1/1268727‑1269210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |