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(MQ=255) cGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGGGGGAAAACTTAGAAGGCATTGAATTTTTTAAACATACCa > 1:274535/1‑251 (MQ=255) gCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTAt < 1:375723/83‑1 (MQ=255) cACCAAGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTTAAACATACCAAC‑TGGAAAATCCATAGCGAAgg > 1:652329/1‑250 (MQ=255) aGATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGGCATTGAATTTTTTAAAAATACCAACTTGGAAAA‑CCATAACGAAGTACCgg > 1:691506/1‑251 (MQ=255) gATTGGAATACGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGCAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGAGATTACAGGCGCGCCGAAGGGCAGTGGAATCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGaa < 1:83649/207‑1 (MQ=255) aCGCTGATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTTAAACATACCAAC‑TGGGAAAACCATAGCGAAggac > 1:198017/1‑235 (MQ=255) gATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTAt < 1:8724/58‑1 (MQ=255) gATTTACAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGGAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTGAAACATACCAAA‑TGGAAAAACCATAGCGAAGTACCGGGGTCTATCGCCAttt > 1:576307/1‑250 (MQ=255) | GTTCTTGGGGTTATCAACCGCTTGGCTTGTATTCGCCGACCAGCCGTTTTGGTACGCCGGAAGGCTTTAAACGCTTGGTAGAGCGGGCGCATGATGCCGGTATTAATGTGATTCTCGACTGGGTGCCGGGGCATTTCCCGAGCGATACCCACGGTTTGGTGGCATTTGGCGGTACGGCATTGTATGAGCACGCCGATCCGCGCGAAGGCTATCACCAAGATTGGAATACGCTGATTTATAACTACGGACGCAACGAAGTTAAGAATTTCTTATCCAGTAATGCGTTGTATTGGCTTGAACGCTTCGGTATCGACGGCATTCGGGTCGATGCGGTGGCGTCTATGATTTATCGTGATTACAGTCGCGCCGAAGGGCAGTGGATTCCGAATCAATACGGCGGGCGGGAAAACTTAGAAGCCATTGAATTTTTGAAACATACCAAC‑TGGAAAATCCATAGCGAAGTACCGGGTTCTATCGCCATTG > 1/1266400‑1266882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |