| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,238,791 | A→G | intergenic (+99661/+154520) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,238,791 | 0 | A | G | 100.0% | 152.5 / NA | 51 | intergenic (+99661/+154520) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (25/26); total (25/26) | |||||||||||
GATTGTAGCCTGTGGAGGCGCGGTCGCCACTTCAACCTTAGCAGCGGAAGAAATCAAAGAATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAAAGAAAATCTTAACAATTTTAAGAGGATAATCATTATGTTTACGCAAATCATGCAGTACA‑TTTTGGATCTCGGGCCGTCGGTCATGCTGCCGATTGTGATTATTATTCTTTCGTTGTTGCTCGGCATGAAAGCCGGCGATTCCTTTAAGGCCGGATTACAAATCGGTATTGGCTTTGTAGGGATCGGGCTGGTTATCGGCTTAATGCTGGATTCTATCGGACCGGCAGCAAAAG > 1/1238550‑1239024 | gATTGTAGCCTGTGGAGGCGCGGTCGCCACTTCAACCTTAGCAGCGGAAGAAATCAAAGAATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAGAGAAAAt > 1:153179/1‑249 (MQ=255)gATTGTAGCCTGTGGAGGCGCGGTCGCCACTTCAACCTTAGCAGCGGAAGAAATCAAAGAATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAGAGAAAAt > 1:475171/1‑249 (MQ=255) ccTGTGGAGGCGCGGTCGCCACTTCAACCTTAGCAGCGGAAGAAATCAAAGAATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGAATTGAACAGCTTAAAGAGAAAATCTTAACAAtt > 1:604092/1‑251 (MQ=255) gtgGAGGCGCGGTCGCCACTTCAACCTTAGCAGCGGAAGAAATCAAAGAATTATGTGAAGAAAACCATATTCCGCTGGAACTGGTACAATGCCGAATCAATGAAATCGACAGTTATATTCAAGATGTGGATTTGATTTGCACCACCTCGAAAATTACCCAAACCTACGGTGATATTCCGATTATACACGGCATGCCTTTTGTTTCCGGTGTCGGTATTGAACAGCTTAAAGAGAAAATCTTAACAATTTTa > 1:641025/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |