| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,225,036 | G→A | intergenic (+85906/+168275) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,225,036 | 0 | G | A | 100.0% | 150.8 / NA | 53 | intergenic (+85906/+168275) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/30); total (23/30) | |||||||||||
AATGCCTTCTGCATACACGAATTGCACATCGGTAATACCCACGAAACCTAAAATCATTTTTAAGTATGCCGTGACGATATCGGAAGATTGATTTTGGTGGAACCCGCCGAATACAGCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCGGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGC‑GGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTT > 1/1224789‑1225281 | aaTGCCTTCTGCATACACGAATTGCACATCGGTAATACTCACGAAACCTAAAATCATTTTTAAGTATGCCGTGACGATATCGGAAGATTGATTTTGGTGGAACCCGCCGAATACAGCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCAGTg > 1:405508/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |