| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 159,816 | C→A | intergenic (‑24365/+53881) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 159,816 | 0 | C | A | 100.0% | 224.0 / NA | 78 | intergenic (‑24365/+53881) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (49/29); total (49/29) | |||||||||||
CATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCTCAATCAAATTCTTCTGCCCATTAAAAACTTTTTCACCTAGCTCACGACAGTATTCTCCGGCAGACCAACGTTTTACCGCTTTAAAAATTTGAGAACCAATGTCGTTTCCCTTAAAAGGTTCTGCACAGTAATGCACTTTAATCCCCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAGCGACGTTGTATAT > 1/159607‑160062 | cATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCTCAATCAAATTCTTCTGCCCATTAAAAACTTTTTCACCTAGCTCACGACAGTATTCTCCGGCAGACCAACGTTTTACCGCTTTAAAAATTTGAGAACCAATGTCGTTTCCCTTAAAAGGTTCTGCACAGTAATGCACTTTAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATtcatc < 1:232738/250‑1 (MQ=255) 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1:777094/236‑1 (MQ=255) gTAATGCACTTTAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATAtttt < 1:850108/241‑1 (MQ=255) gTAATGCACTTTAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAg > 1:300313/1‑250 (MQ=255) gTAATGCACTTTAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAg > 1:744010/1‑250 (MQ=255) 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ttAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAGCGACGTTGtat < 1:294120/251‑1 (MQ=255) ttAATCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAGCGACGTTGtat < 1:261974/251‑1 (MQ=255) aaTCACCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAGCGACGTTGTatat < 1:585937/251‑1 (MQ=255) | CATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCTCAATCAAATTCTTCTGCCCATTAAAAACTTTTTCACCTAGCTCACGACAGTATTCTCCGGCAGACCAACGTTTTACCGCTTTAAAAATTTGAGAACCAATGTCGTTTCCCTTAAAAGGTTCTGCACAGTAATGCACTTTAATCCCCATTTTTGAACAAATTTGTTCATAATGTGCAGATTCATCAATATTTAGAAAGCGCCCCCATCGGCTAATGTCATAAACAAGAATATGTGAAAAATCAGCATTACCGGATTGTACAAAATTAATGAGTGATAAAAACTGAGGACGTTTTTCTGCGCTTAATCCACTCCTTCCCTCATCTAGGTATTCCCTAGTGAGTATAAGCCCTTGTTCCTTAGCATATTTTTGAATGAAGCGACGTTGTATAT > 1/159607‑160062 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |