| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,165,205 | T→G | intergenic (+26075/+228106) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,165,205 | 0 | T | G | 96.3% | 138.8 / ‑4.0 | 54 | intergenic (+26075/+228106) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (12/40); minor base C (2/0); total (14/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
TTGCTCTCATTGCCCACCGCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑TCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGCTATTCCTTCATTCGCCCGAATGCCGCCGTGGTATCCAT > 1/1164966‑1165447 | ttGCTCTCATTGCCCACCGCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAAt < 1:353613/251‑1 (MQ=255) tGCTCTCATTGCCCACCGCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCTATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGG‑ACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTg < 1:436081/251‑1 (MQ=255) ctcATTGCCCACCGCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAg < 1:794678/251‑1 (MQ=255) gCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGG‑TTTTTTTTCGTGCC‑GCCGGAGTTTATTTTAGAGAGTCGCGA‑cc > 1:825867/1‑250 (MQ=255) tGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGgcg < 1:260604/251‑1 (MQ=255) gCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAg < 1:761513/232‑1 (MQ=255) cgcATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAAt < 1:734316/250‑1 (MQ=255) cgcATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAAt < 1:3116/250‑1 (MQ=255) aTGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGAc < 1:402364/251‑1 (MQ=255) cgGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAgg < 1:682404/251‑1 (MQ=255) gAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGa < 1:57371/250‑1 (MQ=255) ttCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGCGGGGA‑TTTT‑TTCCCTGCC‑GCCCGGTTTTATTGAAACGAGGCGCCG‑CCCTGGCGCGTCT‑AAAATTACCGTGTTTTAGGACGTTTATCttccctttccccaaccccgcttt > 1:83092/1‑229 (MQ=255) tGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGCGGGGG‑TTTTTTTCC‑TGCC‑GCAGGATTTTATTTAAGCGGGGCGCGG‑CCCTGGGGCGGCT‑TAATTTATCGTGTTTTAGGACGTTTTTCTTCCGCTGCTCC‑AAAcccctttttttgtg > 1:492282/1‑240 (MQ=255) 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tcatcGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGG‑TTTTTTTCCCCGCC‑GCCGGATTTTATTTAAGCGAGGCGCGA‑CCTTTGGGCGCCTCAAATT‑ACCCTGTTTAAAGACGGTTTTTTGCCGATGGT‑C‑AAAACCACCTTTTTTTCGTCCATttttttttttttt > 1:289326/1‑250 (MQ=255) tcatcGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGt < 1:793827/158‑1 (MQ=255) tcatcGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTCTATCGGC‑GGGG‑TTTTTTTTCCTGCCGCCGGGTTTTAATT‑AAGCGAGTCGCGA‑CCCTGGCGCGGCT‑TTATTTACCGGGGTTTAGGACGTTTTTCTTCCCATGCT‑C‑CAACCCCGGTTTCTTGCGGCCCTTAttttttttttt > 1:886019/1‑250 (MQ=255) ttgttCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGAGTTTTTTTCC‑TGCC‑CCCGGGTTTTATTGAAACGAGGCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑TAATTTACCGTGTTTTAGGACGTTTTTTTTCCGATGCT‑C‑AAAACCCGGTTTCTTGCGTcccctttttttttttttgtgtaaaa > 1:699890/1‑228 (MQ=255) gttCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGG‑TTTTTTTCCCTGCC‑GCAGGGTTTTATTGAAGCGAGTCGCGC‑CCCTGGCGCGTCT‑TAATTTACCCCGTTTTAAGACGGTTTTCTTCCGCTGCT‑C‑AAACCCACTTTTTTTGCGTCCCTTAtttttttttttttggaaaata > 1:170097/1‑240 (MQ=255) cttcAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGgcg < 1:331064/158‑1 (MQ=255) gCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGa < 1:589546/178‑1 (MQ=255) ccGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGCGAAAAGTATTgaagaa < 1:609772/250‑1 (MQ=255) aTGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAAt < 1:572381/125‑1 (MQ=255) aTGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGt < 1:874145/237‑1 (MQ=255) gTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAAcc < 1:247940/195‑1 (MQ=255) aTTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCcatttcatt < 1:313755/250‑1 (MQ=255) ttAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTTTTCCCTGCC‑GCCGGATTTAATTTAAGCGAGTCGCGG‑CCCTTGCGCGGCT‑AAAATTACCGGGGTTTAGGACGGTTTTTTTCCGCTGCT‑C‑AAACCCCGGTTTTTGGCGTCCCTTATTTTTTTTTTTTTGGAAAGAATTgaagaaatttccctttttttttttatcggt > 1:373013/1‑227 (MQ=255) ttAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTg < 1:719937/108‑1 (MQ=255) ttAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGgcg < 1:461093/129‑1 (MQ=255) ttAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAg < 1:729229/152‑1 (MQ=255) ggATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCAc < 1:746053/250‑1 (MQ=255) gTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGG‑TTTTTTTTCGTGCC‑GCCGGGTTTTATTTAAGCGAGGTGCGG‑CCCTTGCGCGGCT‑TAATTGACCGTGTTTTAGGACGGTTTTCTGCCGCTGCT‑C‑CAAACCACTTTTTTTGGGGCCCTTTTTTTTTTTTTTGTGTAAAGAATTGAAAAA‑ATTTCCCTTTTATTTTTGTTCGGTTTCCCCGG‑TTTTATCACCCTGc > 1:725336/1‑250 (MQ=255) gTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCattat < 1:443609/176‑1 (MQ=255) gTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTgaag < 1:658932/202‑1 (MQ=255) ggCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCt < 1:483255/157‑1 (MQ=255) tcgtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTatat < 1:424272/251‑1 (MQ=255) tcgtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTatat < 1:284661/251‑1 (MQ=255) gtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGG‑TTTTCTTTCCTGCC‑GCCGGGTTTTATTTAAGCGAGTCGCGG‑CCTTGGCGCGGCT‑AAATTTACCGTGTTTTAGGACGTTTTTTTTCCGATGCT‑C‑AAACCCCGTTTTTTTGCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTGTGAAAAATATTTAAGAA‑TTTGTCATTTTATTTTTGATTGG‑TTCCCCCGATTTTATCACCGTGCCCACCCtttttttttt > 1:560905/1‑245 (MQ=255) gtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAAt < 1:93973/68‑1 (MQ=255) gtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGAc < 1:592986/104‑1 (MQ=255) gtATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCcatttcatt < 1:526095/203‑1 (MQ=255) aaCGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCg < 1:826395/227‑1 (MQ=255) tGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGG‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGc < 1:501303/251‑1 (MQ=255) tGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGc < 1:701179/251‑1 (MQ=255) tGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGc < 1:405370/251‑1 (MQ=255) gCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTTTTTCCTGCC‑GCCGGGTTTAATTTAAGCGAGGCGCGACCCTTGG‑GCGTCT‑CAATTTACCGTGTTTTAGGACGGTTTTTTTCCGATGCT‑C‑CAACCCCGGTTTTTTGCGTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAAATATTTAAGAA‑TTTGCCCCTTTTTTTTTGTTCGGTTTCCCCGG‑TTTTATCACCCTGCCGCCCCTTTTTTAtttttttcttcg > 1:172657/1‑243 (MQ=255) gCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCgg < 1:662809/209‑1 (MQ=255) gCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCgg < 1:357012/209‑1 (MQ=255) gATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTTTTTCCTGCC‑GCCGGGTTTAATTTAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAAATTAACGGGTTTAAGGACGGTTATCTGCCGCTGGT‑CAAAACCCGGTTTT‑TTGCGTCCATTATTTTTTTTTTTGTGAAAAATATTTAAGAATTTTGCC‑TTTTATTTGTGATCGGTTTCCCCGG‑TTTCATTACCCTGCCGACCCTTTTATTTTTTTTTCTATGCTATTCCTTCAtttgc > 1:706974/1‑247 (MQ=255) a‑TTTTCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTc > 1:387837/1‑214 (MQ=255) tttCTTCCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGCTATTCCTTCATTCGCCCGAATGCCGCCGTGGTa < 1:192565/251‑1 (MQ=255) tcCGTGCC‑GCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGCTATTCCTTCATTCGCCCGAATGCCGCCGTGGTATCCat < 1:426675/251‑1 (MQ=255) | TTGCTCTCATTGCCCACCGCCTATGCCTTCGGGCGCATGGAATTTCGCGGAAAAAAACTGGCTGAGTTGTTGACGTTAATTCCATTGGTGATTCCGGGCATGATCATCGCGTTGTTCTTCAGCCGTATGTTATTGGATTTGAACATTAATAATCCGTTTATCGGGATTGTTATCGGGCACGTCGTATTAACGCTGCCTTACGCCATTCGGATTTTATCGGC‑GGGA‑TTTTCTTCCGTGCC‑TCAGGATTTAATTGAAGCGAGTCGCGA‑CCTTGGCGCGTCT‑AAATTGACCGTGTTTAAGGACGTTTATCTGCCGATGCT‑C‑AAACCCAGTTTTCTGGCGTCCATTATTTTTTGTTTAGTGAAAAGTATTGAAGAA‑TTTGCCATTTCATTTGTGATCGG‑TTCCCCGGATTTCATCACCGTGCCGACCATTTTATATTCTTTCCTAGGCTATTCCTTCATTCGCCCGAATGCCGCCGTGGTATCCAT > 1/1164966‑1165447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |