| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 159,435 | A→C | intergenic (‑23984/+54262) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 159,435 | 0 | A | C | 100.0% | 204.3 / NA | 70 | intergenic (‑23984/+54262) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (42/28); total (42/28) | |||||||||||
GTTTTATTGAGCGTTGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATAACTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCTCAAT > 1/159199‑159676 | gtTTTATTGAGCGTTGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTaaa > 1:446946/1‑251 (MQ=255) cGTTGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAAt < 1:688636/251‑1 (MQ=255) ttGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTGGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGc > 1:442804/1‑231 (MQ=255) ttGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGT‑CACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTg > 1:464184/1‑251 (MQ=255) ataatGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGc > 1:365551/1‑224 (MQ=255) aatGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCg < 1:226720/251‑1 (MQ=255) ggCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGttt > 1:410516/1‑251 (MQ=255) tgctgcATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGt < 1:722876/250‑1 (MQ=255) aaaTAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAAt < 1:388600/222‑1 (MQ=255) ggATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTc > 1:703826/1‑228 (MQ=255) cTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGt < 1:27941/203‑1 (MQ=255) cTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAaata > 1:233699/1‑251 (MQ=255) tttCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCa > 1:834934/1‑251 (MQ=255) ctctTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATaaaa < 1:822204/212‑1 (MQ=255) cATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCg > 1:892223/1‑250 (MQ=255) ttGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCaa > 1:496373/1‑251 (MQ=255) ctctGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGtaaata < 1:201443/193‑1 (MQ=255) aTTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGacac < 1:247483/251‑1 (MQ=255) gTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTg > 1:721787/1‑250 (MQ=255) tAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATg < 1:241902/165‑1 (MQ=255) tAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTg > 1:362243/1‑207 (MQ=255) tCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTaa < 1:825637/124‑1 (MQ=255) gATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAAt < 1:796638/122‑1 (MQ=255) gATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATg < 1:170185/140‑1 (MQ=255) aaaCATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAAtttt > 1:818085/1‑251 (MQ=255) cATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTgg > 1:370065/1‑250 (MQ=255) cATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTgg > 1:368719/1‑250 (MQ=255) cTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAAt < 1:136537/132‑1 (MQ=255) aCATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGAtt < 1:359081/141‑1 (MQ=255) aCATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAg > 1:556267/1‑250 (MQ=255) aCATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGc < 1:165812/251‑1 (MQ=255) cATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTaataat < 1:228932/251‑1 (MQ=255) cATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTaataat < 1:153540/251‑1 (MQ=255) ttaattaGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAg < 1:608333/251‑1 (MQ=255) aattaGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGa < 1:695232/125‑1 (MQ=255) aattaGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAgg > 1:703396/1‑250 (MQ=255) attaGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGaa > 1:589010/1‑169 (MQ=255) attaGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGt > 1:95572/1‑199 (MQ=255) gAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCtt > 1:378996/1‑251 (MQ=255) tGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAAccc < 1:634151/251‑1 (MQ=255) ggACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGAt < 1:733570/108‑1 (MQ=255) gACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGttttt > 1:612884/1‑196 (MQ=255) acacCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAg > 1:99131/1‑250 (MQ=255) ccTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGaa > 1:220693/1‑148 (MQ=255) ccTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAgg < 1:796985/228‑1 (MQ=255) ccTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTgg > 1:44815/1‑251 (MQ=255) ccTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTgg > 1:338412/1‑251 (MQ=255) ttAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTtaat < 1:601823/219‑1 (MQ=255) ttAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTaataat > 1:187173/1‑222 (MQ=255) ttAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATcc > 1:104875/1‑242 (MQ=255) ttAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTc > 1:832855/1‑250 (MQ=255) aGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAgg > 1:123240/1‑223 (MQ=255) aCCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGttttt > 1:159571/1‑179 (MQ=255) aCCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGa > 1:493797/1‑251 (MQ=255) cGTGTATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACg < 1:610424/251‑1 (MQ=255) gtgtATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGc < 1:712998/216‑1 (MQ=255) gtgtATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGa > 1:898792/1‑251 (MQ=255) gtgtATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGa > 1:581815/1‑251 (MQ=255) gtgtATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGa > 1:841057/1‑251 (MQ=255) gtgtATTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGa > 1:301162/1‑251 (MQ=255) aTTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTtaat < 1:18019/205‑1 (MQ=255) aTTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATc < 1:392037/251‑1 (MQ=255) aTTTCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTAAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTaataat > 1:125073/1‑208 (MQ=255) tttCTATCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGCAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACACGCAATAAGAATGACACGATTCGACTGCAAACTCTTc > 1:2535/1‑156 (MQ=255) aTCTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACg > 1:734725/1‑240 (MQ=255) cTGTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTg > 1:811821/1‑152 (MQ=255) gTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTaataat > 1:36572/1‑198 (MQ=255) gTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATc < 1:669228/217‑1 (MQ=255) gTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCt > 1:529845/1‑231 (MQ=255) gTTAAAATACCTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCCGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCtcaat > 1:746448/1‑251 (MQ=255) | GTTTTATTGAGCGTTGGTGAATAATGGCTTGTGCTGCATTAAATAAGGGTTGTGGGATAATTGCTTCAAAAGCATTTTCAACTCTTACCCATTGAGACTCTGGATTTTTACCACGTAACTTCCCCGTCTTTGATGTACAAGATTTATTCCAAACATTGTGCCCTACATATTTTTCATTAATTAGAATCTGATGGACTACACCTTTAGTCCACCGTGTATTTCTATCTGTTAAAATAACTTGGGCATTTAAACTATCTGCAATTTGTCGTTCCGTTTTATGTCTGTAAATAAAATCGTGATAGATTTGTAAAATAATTTTCTGTTCAAATTCAGGACCCGCAATAAGAATGACACGATCCGACTGCAAACTCTTCCTGTCACCCGTTTTTAGTTCAAATTTTGGCGAACCATCAGCACTTAATAATAGGCGTCTTAACCCAAATCCAGCTGGTCCACCTTGACGAAATCCGCGCTCAAT > 1/159199‑159676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |