| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,163,916 | T→C | intergenic (+24786/+229395) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,163,916 | 0 | T | C | 100.0% | 216.8 / NA | 74 | intergenic (+24786/+229395) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (41/33); total (41/33) | |||||||||||
TTTATGGGCAATATCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTTGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTG > 1/1163669‑1164156 | tttATGGGCAATATCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTcgtg > 1:277001/1‑251 (MQ=255) atatCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGc > 1:196561/1‑250 (MQ=255) tCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTg > 1:493543/1‑251 (MQ=255) tGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:651940/250‑1 (MQ=255) tGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTGTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:789192/250‑1 (MQ=255) gCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGtt > 1:655375/1‑239 (MQ=255) gTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATggcggg < 1:507851/250‑1 (MQ=255) aCGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGtt > 1:358462/1‑229 (MQ=255) cGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGaa < 1:712361/251‑1 (MQ=255) gagaAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGc > 1:555889/1‑209 (MQ=255) agaAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATCAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAg < 1:441719/249‑1 (MQ=255) aaaaTTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:298050/216‑1 (MQ=255) aaTTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAat < 1:684734/251‑1 (MQ=255) aaTTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAat > 1:497523/1‑251 (MQ=255) cAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAAc > 1:492697/1‑250 (MQ=255) tAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCgtgt < 1:807850/251‑1 (MQ=255) aaTTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGgtg > 1:275161/1‑251 (MQ=255) aTACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc > 1:363243/1‑175 (MQ=255) tGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTGGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATc < 1:885950/251‑1 (MQ=255) gACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAAt > 1:185387/1‑225 (MQ=255) ttACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTAtt > 1:828260/1‑251 (MQ=255) tACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc < 1:835009/251‑1 (MQ=255) gTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:38519/158‑1 (MQ=255) gTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCt < 1:69620/241‑1 (MQ=255) gTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTg > 1:584963/1‑251 (MQ=255) cTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc > 1:897586/1‑243 (MQ=255) tCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:5335/153‑1 (MQ=255) gCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTg > 1:776755/1‑251 (MQ=255) ccATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCgg < 1:586128/209‑1 (MQ=255) ttAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGGGTTTCAAAAGTCCTATc > 1:79362/1‑224 (MQ=255) aTTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGc < 1:116759/251‑1 (MQ=255) ttCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc < 1:412206/137‑1 (MQ=255) ttCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc < 1:233569/226‑1 (MQ=255) cTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTc < 1:423570/166‑1 (MQ=255) cGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCta > 1:118983/1‑251 (MQ=255) tctcAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc > 1:306684/1‑201 (MQ=255) tGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCa < 1:516787/251‑1 (MQ=255) ttAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCAtgtg < 1:117340/251‑1 (MQ=255) aGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTg > 1:780677/1‑250 (MQ=255) gCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGcc < 1:682204/82‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGgtgt > 1:429635/1‑156 (MQ=255) ctgctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAAt > 1:418675/1‑141 (MQ=255) ctgctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAg > 1:325881/1‑143 (MQ=255) ctgctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc > 1:722912/1‑173 (MQ=255) ctgctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTTCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGAttt > 1:733633/1‑202 (MQ=255) ctgctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAAc < 1:752904/250‑1 (MQ=255) gctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTAcccc < 1:599128/223‑1 (MQ=255) gctATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTg > 1:484205/1‑250 (MQ=255) aTGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTgg < 1:362649/72‑1 (MQ=255) ggTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGt > 1:244830/1‑251 (MQ=255) gTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAAt > 1:61616/1‑128 (MQ=255) aTCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc > 1:495374/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTaccacc < 1:590212/251‑1 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTtat > 1:784494/1‑53 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATAc > 1:160518/1‑55 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACta < 1:676268/239‑1 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCAc < 1:212621/246‑1 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCAt > 1:64060/1‑249 (MQ=255) gTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCAt > 1:754100/1‑249 (MQ=255) ttttAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTa > 1:87487/1‑251 (MQ=255) ttAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTTTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACg < 1:439166/251‑1 (MQ=255) ggTCCACGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACg < 1:328741/244‑1 (MQ=255) aCGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGc < 1:415646/173‑1 (MQ=255) aCGTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATg > 1:138577/1‑249 (MQ=255) gTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTc < 1:730477/126‑1 (MQ=255) gTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGt > 1:202257/1‑238 (MQ=255) gTTCTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGACTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTgg > 1:454460/1‑251 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGa < 1:386564/51‑1 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGgtg < 1:548375/100‑1 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCAc > 1:892675/1‑225 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCAc > 1:454723/1‑239 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTg > 1:646191/1‑250 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTg > 1:509128/1‑250 (MQ=255) cTATATTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGGCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGt > 1:633399/1‑235 (MQ=255) atatTGTCGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCtattat > 1:330574/1‑160 (MQ=255) | TTTATGGGCAATATCACAGAAGTGCAGGGCATGGTGCAACGGGACGGCGAAGAGAAAAAATTACGTTTGCAATTAACGAAATGCCCGAATTTGAGCGATACGCTGACGTTTACGGTTCCTCGTAATGCCATTAAATTCTTGGAGTCGGTAAAATGAAAAATCTCAAAAATGATTTAAAAGCCTGGCTGCTGCTATGCAGTGGTTTGGGAACGATCCTGTTTTTAATGGGGTCCACGTTCTATATTGTTGTGTCGCAGAGCCTTGGTTTATACAGCATGGCGGGCGAGGAAAGCCGATTTAGTCTGGAATATTGGCAAACCGTGTTGAATAGCCCGGTGTTTCAAAAGTCCTATCTTTATTCCGTGAAAGTGTCATTGCTGGGGGCGATTTTCTCTATTATCGTGGCTTACCCCATTGCCATGTGGCTGCGTAAAAAACTGCCGGCAAAAGTCACTATTATCACCATCTTACGTGCACCGATGCTGGTG > 1/1163669‑1164156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |