| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,136,158 | G→A | intergenic (+20668/‑2896) | unknown → / → unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,136,158 | 0 | G | A | 98.5% | 189.5 / NA | 65 | intergenic (+20668/‑2896) | unknown/unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (38/26); total (38/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGGGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCATACCGT > 1/1135923‑1136402 | cGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGAc < 1:206468/251‑1 (MQ=255) aTGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATggc > 1:623826/1‑246 (MQ=255) aTGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCaa > 1:347046/1‑251 (MQ=255) aTGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCaa > 1:435009/1‑251 (MQ=255) aTGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCaa > 1:593464/1‑251 (MQ=255) aTGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCaa > 1:265469/1‑251 (MQ=255) gTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAAt > 1:621315/1‑250 (MQ=255) gTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAAt > 1:41830/1‑250 (MQ=255) taataaCAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCg > 1:682178/1‑251 (MQ=255) gaagaaTCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGc < 1:268698/250‑1 (MQ=255) aTCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTgt < 1:308434/251‑2 (MQ=255) gCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCa > 1:83888/1‑251 (MQ=255) gCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCa > 1:182173/1‑251 (MQ=255) ccTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGAc < 1:740402/195‑1 (MQ=255) tACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGCGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTgg > 1:880851/1‑250 (MQ=255) ttAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCcacac < 1:688875/251‑1 (MQ=255) ttAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCcaca > 1:814293/1‑250 (MQ=255) cgcgcCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTaa < 1:576735/251‑1 (MQ=255) cTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCg > 1:706301/1‑251 (MQ=255) cTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCg > 1:685194/1‑251 (MQ=255) cTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCg > 1:173880/1‑251 (MQ=255) tCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCTGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGt > 1:836052/1‑250 (MQ=255) gatgTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGGAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCAtttt > 1:7607/1‑250 (MQ=255) gTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGa > 1:613204/1‑170 (MQ=255) gTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCcacac < 1:847943/222‑1 (MQ=255) ttttCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAAt < 1:688759/250‑1 (MQ=255) gTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGc < 1:334672/139‑1 (MQ=255) ttCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGAt < 1:99510/251‑1 (MQ=255) ctacGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGGAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAAtt > 1:228081/1‑189 (MQ=255) ctacGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGGCGGCGTGGTGCCGGCGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTTACCTTATTTCCGGGGGCCCTCCACACATCTAATTTTCTGTTGCCCTCATTTAAAAGGGCAAAAAGTGCCGGCGGATTTTCTATTAAAACGGATGCa > 1:561947/1‑251 (MQ=255) ggTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGc < 1:453522/161‑1 (MQ=255) ggTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCCAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGaa > 1:266514/1‑249 (MQ=255) ggTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGaa > 1:291204/1‑249 (MQ=255) taataaTTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTcg > 1:586957/1‑250 (MQ=255) ttCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCgg > 1:216018/1‑247 (MQ=255) gCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg > 1:371714/1‑251 (MQ=255) ccTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCCCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAAATCGCGGTGATCAGAggg > 1:556578/1‑250 (MQ=255) cTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGtt < 1:626197/251‑1 (MQ=255) tttGGTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCg < 1:723104/251‑1 (MQ=255) ggTGTGGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGATGTTTCCGTTa > 1:836612/1‑251 (MQ=255) gtgGGTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGc < 1:596461/86‑1 (MQ=255) gggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGc < 1:351100/107‑1 (MQ=255) gggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg < 1:11308/237‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCGTCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAAt < 1:364332/170‑1 (MQ=255) ggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAgccg > 1:43397/1‑250 (MQ=255) ggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGGGATCAGAGGGTTCCGTTAAgccg > 1:183241/1‑250 (MQ=255) cTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAAcc > 1:812825/1‑211 (MQ=255) cTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg < 1:776421/231‑1 (MQ=255) gtgTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCg < 1:789612/205‑1 (MQ=255) gTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg > 1:208470/1‑224 (MQ=255) gTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGGTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTg > 1:49741/1‑251 (MQ=255) gAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATTCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGGGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCa > 1:532790/1‑251 (MQ=255) gAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGcc > 1:743212/1‑144 (MQ=255) gAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGGAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCCTTGCCa > 1:694341/1‑251 (MQ=255) cGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGGAACTTTATCGCCGTGGCTCATCcacac > 1:413210/1‑118 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGc < 1:611462/100‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGtt < 1:361021/246‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCAt < 1:324671/251‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCAt < 1:700219/251‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCAt < 1:660629/251‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCAt < 1:378369/251‑1 (MQ=255) ccGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAAAGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCAt > 1:610640/1‑251 (MQ=255) tAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCATAc < 1:361551/250‑1 (MQ=255) aaaCGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCATACCGt < 1:216163/250‑1 (MQ=255) aaaCGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGGAACTTTATTGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGGCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAAc > 1:549417/1‑184 (MQ=255) | CGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGGGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCGCCAAGCTGCATTGCCATGGTTTGCATACCGT > 1/1135923‑1136402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |