| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,136,133 | G→T | intergenic (+20643/‑2921) | unknown → / → unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,136,133 | 0 | G | T | 100.0% | 182.9 / NA | 64 | intergenic (+20643/‑2921) | unknown/unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (36/28); total (36/28) | |||||||||||
AAACCGTTATCCACGAACACGCAATGTAAGTTTTTGCCGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGGGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCG > 1/1135886‑1136371 | aaaCCGTTATCCACGAACACGCAATGTAAGTTTTTGCCGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGtgtg > 1:864970/1‑251 (MQ=255) 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1:596461/86‑1 (MQ=255) gggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGc < 1:351100/107‑1 (MQ=255) gggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg < 1:11308/237‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCGTCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAAt < 1:364332/170‑1 (MQ=255) ggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAgccg > 1:43397/1‑250 (MQ=255) ggTTACTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGGGATCAGAGGGTTCCGTTAAgccg > 1:183241/1‑250 (MQ=255) cTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAAcc > 1:812825/1‑211 (MQ=255) cTTCAGTGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGACGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAgg < 1:776421/231‑1 (MQ=255) | AAACCGTTATCCACGAACACGCAATGTAAGTTTTTGCCGATAGCGCGATGTAATAACAGCGCCACCACGGAAGAATCCACGCCGCCGGATAAGCCTAAAATCACTTCGTCATCACCTACTTGCGCTTTAATGCGCGCCACGGCATCTTCAATGATGTTTTCTGCCGTCCATTTGGTTTCGCAACCGCAAATGTTTACTACGAAATTGGTTAATAATTCCAAGCCTTTTTTGGTGTGGGTTACTTCAGGGTGGAATTGCACGCCGTAGAAACGGCGATTTTCATCAGACATGGCGGCAATCGGGCAGGTCGGCGTGGTGCCGGTGATTTGGAAGTCCTTCGGCAGGCGGGTAACTTTATCGCCGTGGCTCATCCACACATCTAATTTGCTGTCGCCGTCATTTAAATGGGCAAAAAGTGCGGTCGGATTTTCTATTAAAACGGAGGCATAACCGAACTCGCGGTGATCAGAGGTTTCCGTTAAGCCG > 1/1135886‑1136371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |