| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,132,505 | C→T | intergenic (+17015/‑6549) | unknown → / → unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,132,505 | 0 | C | T | 100.0% | 142.4 / NA | 48 | intergenic (+17015/‑6549) | unknown/unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (31/17); total (31/17) | |||||||||||
ATATTTTTTAATAAAGAAACTCTATTATGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTCATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGAACACCCTGTCT > 1/1132261‑1132748 | atatTTTTTAATAAAGAAACTCTATTATGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCt < 1:401517/251‑1 (MQ=255) taaAGAAACTCTATTATGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGAt > 1:246261/1‑251 (MQ=255) ctATTATGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTa > 1:485288/1‑251 (MQ=255) atGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGaa > 1:412970/1‑250 (MQ=255) 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tataTCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAAt < 1:389414/251‑1 (MQ=255) ccGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAAcc < 1:63061/196‑1 (MQ=255) cGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTAt > 1:418759/1‑251 (MQ=255) 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ctATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTgtaatgtaat > 1:719301/1‑251 (MQ=255) ctATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTgtaatgtaat > 1:680186/1‑251 (MQ=255) gcgctACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATca > 1:72039/1‑251 (MQ=255) gTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATAc > 1:673121/1‑232 (MQ=255) ttGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGc < 1:854569/251‑1 (MQ=255) aTTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTgtgt > 1:73283/1‑250 (MQ=255) 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1:309081/236‑1 (MQ=255) aTGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGctt > 1:449685/1‑251 (MQ=255) gTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGc > 1:151967/1‑178 (MQ=255) ctACTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAAc > 1:429134/1‑44 (MQ=255) aCTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAg > 1:470140/1‑251 (MQ=255) aCTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAg > 1:714650/1‑251 (MQ=255) cTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATAcccc > 1:806993/1‑202 (MQ=255) cTTGAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGa < 1:859442/251‑1 (MQ=255) gAATATATAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATcac > 1:228498/1‑144 (MQ=255) atatatAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAAt < 1:879886/75‑1 (MQ=255) atatatAATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGAacac > 1:461843/1‑250 (MQ=255) atataATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATAccc > 1:422843/1‑194 (MQ=255) atataATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCa < 1:220784/197‑1 (MQ=255) tataATGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGAACAcc > 1:354522/1‑248 (MQ=255) aaTGATTTATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGAACACCCTGTCt < 1:768994/251‑1 (MQ=255) | ATATTTTTTAATAAAGAAACTCTATTATGATAATGTCGCCAAGGATCATCTGGTTTATATCCGGTGGACCGATAAATGTACTCTTTTAAGCCAAGTGAAGCTAGCTCTCTATATGAGCGCTGCGCTACAGTTTTGTCTGACTTTGACGATTCAAATGCATAAAACTCCAATATCGCCATACAAACAATATCAGGATATGCATAATGTATCGCCCCATTTTTCTCTACTTGAATATATAATGATTCATCGCTAAACCCGCGATTAAACAGGTACGAACTTAAAAAAGTCATTCTATTTGTGGTAAATAGGCCACTTTGTATGGAAGAAGTCCACTCTGAAGATAATTCTTGTAATGTAATACGAGAAATATCACATACTTTAGCTAATCCTGTTTGTGTCAAGTAAGGAATGCCATTTCCTAATACCCCCATGCCAATTCCATTTATTTCTGCTTCTTTATCGATAGAAATATCAAGAACACCCTGTCT > 1/1132261‑1132748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |