| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,127,688 | A→C | intergenic (+12198/‑11366) | unknown → / → unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,127,688 | 0 | A | C | 100.0% | 157.7 / NA | 53 | intergenic (+12198/‑11366) | unknown/unknown | tRNA‑Gln‑TTG/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (28/25); total (28/25) | |||||||||||
AATTATATGAAATGGGGAAGTATCCCACTCGATTATTTATCGGCGATATAATGCAATGATTTATAAATGAATAAAAATGATATTGTTTATTCTCTACCGTCATTTTTACCGTCACCAGAAGAAAATGCCATCAAGAACGTTCAGCAAGCCAAGTATCAATATCAGATTTTCTCCACGCTACACGGCCCATAGACGCTTTAACACTTTTGGGGAATTTACCTTGTTTAATCATACGCCAAATTGTTGTGTCGCTCAAGCTGGTGACTTCAATCACCTTTGCTTTACTTAGTAGCGCTGGTTGTTGTTCCATTATTCTTCTCCATTAAAACAAAAAGCCCATTTCTGGGCTTGTTATCTAACCAATATCGCGATTTAATATTTCGCGGATCTTGTCGCCTGATTTCTGCTCAATGAAATCATTTATCACTTTATACAATCGCCATTTGTATTTAAGAGGTATTTTTGTG > 1/1127462‑1127928 | aaTTATATGAAATGGGGAAGTATCCCACTCGATTATTTATCGGCGACATAATGCAATGATTTATCAATGAATAAAATTGATATTGTTTATTCTATACCGTCATTTTTACCGTCTTTGGAAGAAAATGCCATCAAGAACGTTCAGCAAGCCAAGTATCAATATCAGATTTTCTCCACGCTACACGCCCCATGGACGCTTTAACACTTTTGGGGAATTTACCTTGTCTCATCATACGCCAAATTGTTGTGTCg > 1:353600/1‑251 (MQ=255) 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AATTATATGAAATGGGGAAGTATCCCACTCGATTATTTATCGGCGATATAATGCAATGATTTATAAATGAATAAAAATGATATTGTTTATTCTCTACCGTCATTTTTACCGTCACCAGAAGAAAATGCCATCAAGAACGTTCAGCAAGCCAAGTATCAATATCAGATTTTCTCCACGCTACACGGCCCATAGACGCTTTAACACTTTTGGGGAATTTACCTTGTTTAATCATACGCCAAATTGTTGTGTCGCTCAAGCTGGTGACTTCAATCACCTTTGCTTTACTTAGTAGCGCTGGTTGTTGTTCCATTATTCTTCTCCATTAAAACAAAAAGCCCATTTCTGGGCTTGTTATCTAACCAATATCGCGATTTAATATTTCGCGGATCTTGTCGCCTGATTTCTGCTCAATGAAATCATTTATCACTTTATACAATCGCCATTTGTATTTAAGAGGTATTTTTGTG > 1/1127462‑1127928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |