| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,108,726 | C→T | intergenic (‑184009/‑6382) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,108,726 | 0 | C | T | 100.0% | 230.3 / NA | 80 | intergenic (‑184009/‑6382) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (32/48); total (32/48) | |||||||||||
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cTAACGGACAAATTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTAttt < 1:270440/139‑1 (MQ=255) aCGGACAAATTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTc < 1:75816/137‑1 (MQ=255) cGGACAAATTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTAttc > 1:315391/1‑186 (MQ=255) aCAAATTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCggg < 1:366177/251‑1 (MQ=255) aaTTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTc < 1:62384/60‑1 (MQ=255) attTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTa > 1:560033/1‑250 (MQ=255) attTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTa > 1:702667/1‑250 (MQ=255) cGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGTAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAatat < 1:342223/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aCAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAATATACATAAAAt < 1:48543/251‑1 (MQ=255) aCAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAATATACATAAAAt < 1:83544/251‑1 (MQ=255) aCAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAATATACATAAAAt < 1:626058/251‑1 (MQ=255) 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aaGCCTCCGCGCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAATATACATAAAATAGATTGGGa < 1:126254/251‑1 (MQ=255) cgcgCAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGc > 1:880487/1‑83 (MQ=255) cAAAATGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGACGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATc < 1:447323/208‑1 (MQ=255) | GGGCGGTTGTGCAGGCGATTTTTTATAGGAACTTTTAATTGAGGGAAAGAGTCAAAAATATGCCTTTTCGGCAAGGAACAAAATAACTGTTAAGTAACGATTAAACCCGGGAGAAATTAAAATGGCACAAGGATATTACGAATTAAAATTAGCAAAAGATGGACAATTTATGTTCAATTTAATGGCAACTAACGGACAAATTATTTTAACCAGCGAGCTTTACAAAT‑CGAAAGCCTCCGCGCAAAACGGCATTGCCTCCGTGCAAAAAAACGGAGTGGATGCAAAAAACTTTGAATTTCGTACCACAAAAAATGATCAGCCTTATTTCGTATTAAAAGCGGCAAATCATCAGGAAATCGGTCGCAGCCAATATTATTCTTCGCAAGCTGCTGCACAAAAAGGTGTAGAGTCCGTAATGAACAACGCTTCCAGCGAAGATATTCGGGATCTTACCGTATAATATACATAAAATAGATTGGGA > 1/1108480‑1108960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |