| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,019,136 | T→G | intergenic (‑94419/‑95972) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,019,136 | 0 | T | G | 100.0% | 236.3 / NA | 78 | intergenic (‑94419/‑95972) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (39/39); total (39/39) | |||||||||||
GTATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTTCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAACAATTTCCTCTTTGT > 1/1018897‑1019375 | gTATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTaaataaat > 1:564464/1‑251 (MQ=255) tATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTtaaac < 1:432530/246‑2 (MQ=255) tATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTaaataaat > 1:376882/1‑250 (MQ=255) tATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTaaataaat > 1:137746/1‑250 (MQ=255) tATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTaaataaat > 1:401638/1‑250 (MQ=255) atatTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGa > 1:203707/1‑251 (MQ=255) atatTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGa > 1:745636/1‑251 (MQ=255) gCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCGGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGAttttt > 1:429551/1‑251 (MQ=255) gCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGAttttt > 1:248478/1‑251 (MQ=255) tAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTgg < 1:633035/251‑1 (MQ=255) cGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAg < 1:76866/251‑1 (MQ=255) tGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGAtt > 1:226950/1‑251 (MQ=255) gTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCg > 1:214624/1‑214 (MQ=255) gTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGt > 1:315802/1‑215 (MQ=255) gTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGAttt > 1:519610/1‑251 (MQ=255) gTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGAttt > 1:788001/1‑251 (MQ=255) aGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGc > 1:149964/1‑213 (MQ=255) cGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTtaaata < 1:804324/197‑1 (MQ=255) cGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGttt > 1:226185/1‑251 (MQ=255) cGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGttt > 1:645494/1‑251 (MQ=255) cTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTg > 1:119312/1‑251 (MQ=255) gCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTtaaat > 1:171985/1‑187 (MQ=255) tgtTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGa < 1:698507/250‑1 (MQ=255) tgtTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGAt < 1:478471/251‑1 (MQ=255) tgcttgcCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTtaaa > 1:265509/1‑174 (MQ=255) ggAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACtt > 1:624391/1‑251 (MQ=255) gagaTTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACtt < 1:286827/250‑1 (MQ=255) aTTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTtgatg > 1:775106/1‑251 (MQ=255) aTTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTtgatg > 1:821986/1‑251 (MQ=255) tttAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGAc < 1:560292/251‑1 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCataat < 1:355416/251‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:747219/250‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:339999/250‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:626102/250‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:81562/250‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:490249/250‑1 (MQ=255) ccGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACg < 1:15189/249‑1 (MQ=255) tCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:486010/225‑1 (MQ=255) caAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGt < 1:740916/251‑1 (MQ=255) aaTGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTg > 1:864623/1‑251 (MQ=255) aGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCataat < 1:799865/214‑1 (MQ=255) gTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCg < 1:9318/155‑1 (MQ=255) tGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCAcgc < 1:462463/250‑1 (MQ=255) aTTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTa < 1:213181/251‑1 (MQ=255) aTTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTa > 1:560768/1‑251 (MQ=255) ttACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTaa > 1:669532/1‑251 (MQ=255) ttACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTaa > 1:53474/1‑251 (MQ=255) aCATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAg < 1:726888/168‑1 (MQ=255) aCATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTa < 1:308630/186‑1 (MQ=255) aCATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCataat > 1:566864/1‑207 (MQ=255) aCATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCa < 1:851855/227‑1 (MQ=255) cATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAat > 1:842594/1‑251 (MQ=255) aTAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAata < 1:325917/251‑1 (MQ=255) gAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATAtctc > 1:554681/1‑243 (MQ=255) gTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtacta > 1:412677/1‑180 (MQ=255) gTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGc < 1:804289/188‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATAtctc < 1:379213/226‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTaa > 1:15656/1‑237 (MQ=255) gTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCttt > 1:401626/1‑251 (MQ=255) tCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGa > 1:661005/1‑251 (MQ=255) ccAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGAc < 1:535127/251‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAg < 1:574535/250‑1 (MQ=255) cTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAgg < 1:837453/251‑1 (MQ=255) tGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCataat > 1:267329/1‑163 (MQ=255) tGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAAtac < 1:206777/165‑1 (MQ=255) tGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCg > 1:96483/1‑251 (MQ=255) cTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGAt > 1:829652/1‑200 (MQ=255) taattaatTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATa < 1:542850/251‑1 (MQ=255) taattaatTAGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATa < 1:293630/251‑1 (MQ=255) attaattaGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAAc < 1:579277/251‑1 (MQ=255) aattaGCTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAACAAt < 1:745867/251‑1 (MQ=255) cTAAAAAAATAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAACAATTTCctc < 1:701366/251‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAACAATTTCCTCTttgt > 1:691665/1‑251 (MQ=255) aaaTAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGa > 1:111420/1‑90 (MQ=255) aaaTAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCataat > 1:281472/1‑128 (MQ=255) aaaTAATCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAg < 1:400109/191‑1 (MQ=255) aataatCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTaa < 1:474951/188‑1 (MQ=255) atCCTGCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAAc < 1:234111/231‑1 (MQ=255) | GTATTAAAGAAGATATTGCTGTAAGCAACGCAATTACTTGTTTAAAAGGCACGCTAGAAGGCTTTAAAGTGTTGCTTGCCCAACAGCGGGAGATTTTAGCCCTTGCCGGCGAAGCCGGTGATGAAGGCACTGTTTCACAAATGAGTGATTACATAAAAGAGCAAGAAAAACTGGTTTGGATGTTCCAGGCAGCTTGTCAAGCTTGTGCAAGCTAATTAATTAGCTAAAAAAATAATCCTTCTTAAATAAATCGTTAAGCAGGATTTTTTTGGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCGAGCGTTTTGAAAACATCTTTAAGATTCACCGCACTTTTTTACTTGATGACCATCCCCATAATACTACGTGTTGCTTCCTTCACTTCCGTGAGTTGCACGCGTAAAATATCTCCGATCTTGTAAAGACGCTGATCTTTGACATAGAAGGCGATTTCGTCGGTATTGATAACAATTTCCTCTTTGT > 1/1018897‑1019375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |