| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 138,039 | C→T | intergenic (‑2588/+75658) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 138,039 | 0 | C | T | 100.0% | 190.5 / NA | 66 | intergenic (‑2588/+75658) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/37); total (29/37) | |||||||||||
CACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGCGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACACTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGCCTTAACGG > 1/137799‑138281 | caccacTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCt < 1:494189/251‑1 (MQ=255) 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ccATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCtt > 1:587053/1‑251 (MQ=255) ccATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCtt > 1:563611/1‑251 (MQ=255) attattCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTg > 1:586841/1‑250 (MQ=255) 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cTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGcc < 1:22772/251‑1 (MQ=255) aTTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAAc < 1:625370/216‑1 (MQ=255) cGCCATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTa > 1:462350/1‑251 (MQ=255) ccATGGCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTAt < 1:513538/250‑1 (MQ=255) gCAGGTATCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGc > 1:345022/1‑249 (MQ=255) aTCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGCCTTAACgg < 1:541636/251‑1 (MQ=255) aTCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGCCTTAACgg < 1:736111/251‑1 (MQ=255) aTCGTCGGTGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACATTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGCCTTAACgg < 1:74061/251‑1 (MQ=255) | CACCACTGCCGCCATTATTCCGCTGAGTATTTGTGCCATGCCGTTTGTGGCGCGTTTAACCGCCAACGCCTTGGTTGAAATTCCAAAAGGCTTAACGGAAGCAGCAAAAGCCATGGGCGCCACCAATTGGCAGATTATCCGTAAATTCTATTTGCCGGAAGCTTTGCCAACACTCATTAACGGCATCACCCTGACGCTGGTCACCCTTGTGGGCTATTCCGCCATGGCAGGTATCGTCGGCGGCGGTGGCTTAGGCAGCCTTGCCATTAACTACGGTGAATATCGCAATATGACCTATGTAAAATGGGTCGCCACCATTATTATTGTGGTATTCGTCATGATTTCACAAAAACTTGGCGATGACTTGGCAAAACGTGTCGATCATCGTTAGTTAACTTCACACTGACATAAAAAGGGGATCTTTTATGAACTTGAAAAAATTATTAGGCGTCGCAACATTAGCCTCCGTATTCGCCTTAACGG > 1/137799‑138281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |