| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | 1 | 98,588 | 0 | G | A | 74.6% | 262.8 / 98.3 | 190 | intergenic (+93981/+31917) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/27); new base A (71/70); total (92/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TTAATATGCTACCTATATCCGCTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTGTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGG > 1/98338‑98826 | ttAATATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTg > 1:387928/1‑251 (MQ=37) 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TTAATATGCTACCTATATCCGCTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTGTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGG > 1/98338‑98826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |