| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | 1 | 294,674 | Δ1,609 bp | intergenic (‑10045/‑67045) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | 1 | 294674 | 296282 | 1609 | 132 [0] | [0] 130 | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 294673 | 0 (0.000) | 127 (1.470) | 80/420 | 0.0 | 100% | intergenic (‑10044/‑68654) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| ? | 1 | 296283 = | 0 (0.000) | intergenic (‑11654/‑67044) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CTTGCCGGCTGCACACCAACCATTCAGCTTGATACGCCCAAAGAAGGCATTACTATCAATATGAACGTGATTGTGGATCACAATATTAACGTCAAAATAGATGAAAAAACCAAAGTGACTGCCGGAGAAAATAGCGCAGTTGAAGCGAACAAAACGCCGGCGGAAAAATAAAACGGATTAGCGCATCACAAATCGTCTAATAATTACGCAGAAAATTAAGTCGCCACAAAATGAAAAGGGGAAACCATGTCACTTTCTGATTTATTAACACGATCGACATCCCATGCGCTATTAAGATCCCGAGAGATGGCTCATCTGCTTACCATTTAAGGATATGATATTTATCAGCATAAAGTACGGCAGGTTTACTATCTTTCATTTAACGCTATATTTTGCTATCATTAGCGCAATTTGGGGCTGATTCTGGATTCGACGGGATTAGCGAAGCCCGAAGTGCACGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAATAAACCGCAAAAA > 1/296037‑296533 | aaatggataacctgcaaccggatgccaaaattcatgttcgcctgccgttggacgatgtgttaatcgggcgctatggactggaaggacggctacaggcaactttgcaaggcttcaccccgcaatttgagaacctcaatttgaaattggacggacaggcacacgagttcatcgccggcattaaaaccgtctttgaattgcgtgacgaacaacaaaatctgcacaatgcagaaatgcgtgcggcaaaccATGTc < 1:201310‑M2/5‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |