| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,293,122 | 737 bp→TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT | intergenic (+153992/+99453) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1293122 | 1293858 | 737 | 36 [1] | [0] 28 | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1293121 | 1 (0.010) | 27 (0.350) +TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT |
19/380 | 2.5 | 98.4% | intergenic (+153991/+100190) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1293859 = | 0 (0.000) | intergenic (+154729/+99452) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTTTTAACGGGTAAATCCAAAAATGATACTAGGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGCGCTTAAATTTAAGCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCTTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGAAACGCGCCTTTAATTTATGCTTACATTTCATCAATCACGTCTAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGTCACTAATTTCGCATAATGATTTTTCGGATTATGTTACAATTCGCAGCGCGGTATAATCGCGCAGGACCGCGCAAGAATTTATACATAATCCGTGATTATGCGAATTTAACTTATTGATATTAATAATTATTATGAGCGATTTAACAATAAAATATATAACGCCAA > 1/1292874‑1293370 | gtttgatagttttttaacgaaattGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGat > 1:297496/24‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |