| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 2,067,677 | (CAA)2→3 | intergenic (‑167934/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 2067671 | 0 (0.000) | 92 (1.060) +CAA |
67/412 | 0.1 | 100% | intergenic (‑167928/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| ? | 1 | 2067672 = | 0 (0.000) | intergenic (‑167929/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGGCAAAGGCAGTTTGGATAAAATCAGCTACACCCTTACCGCTTCGGGCACGGCTGCCAGCGGGGTCAGCTGGAACGCCGCCTGCGGCAATAATGCCGACATTTTCCCGGCAGGTTTCTGTTCTTAATCACTAACGCAGCGGGGCAATGATCCATGCAAAATCCGATGGCGCAAGGTTATTTGATTCACAGCCAAAATCACGGGGACTTTACCATTGCGCCCGAGCTATGGCTTAAAAATCAGCAACAAACCGTCCTGTTGCGTTATCTCGCCCTGCCCTTAGCAGAAAACGGGCAGACCTTGTGGCTAGGGTTAGACTCGTTAACTAACCTGAGCGCCTGTGAAGCCTTTTCTTTTCTCACCGGCAAAACCATTGAGCCGGTATTAATTGAAAGCCAAACGCTAAAAACCGCATTGCAGGATTTATCCCCGCGCGTCGAAAAAGTCGAAGAAAATCAACCGCTCTTTTATTCCGCACTGTCACAGGAAC > 1/2067429‑2067918 | caaaggcagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAAc < 1:728359‑M2/8‑1 (MQ=255) aaaggcagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAAcc < 1:887377‑M2/9‑1 (MQ=255) cagtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTcc < 1:646195‑M2/13‑1 (MQ=255) gtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTc > 1:154883‑M2/236‑247 (MQ=255) gtttggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTc > 1:495740‑M2/236‑247 (MQ=255) ggataaaatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatccatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTGCg > 1:127187‑M2/232‑251 (MQ=255) aatcagctacacccttaccgcttcgggcacggctgccagcggggtcagctggaacgccgcctgcggcaataatgccgacattttcccggcaggtttctgttcttaatcactaacgcagcggggcaatgatctatgcaaaatccgatggcgcaaggttatttgattcacagccaaaatcacggggactttaccattgcgcccgagctatggcttaaaaatcagcaaCAACAAACCGTCCTGTTg < 1:231676‑M2/18‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |