| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,397,119 | Δ3 bp | intergenic (‑3732/+16184) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1397119 | 1397121 | 3 | 46 [0] | [0] 46 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1397118 | 0 (0.000) | 46 (0.530) | 41/426 | 0.8 | 100% | intergenic (‑3731/+16187) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1397122 = | 0 (0.000) | intergenic (‑3735/+16183) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
CCATTTAACAACACCAACTTCCATAATTCAAACCTCTTATGGTTTTTTAGTCCTTATAGAACTACATTTACTTCAATAAGACAAAATGCCCTATCACCTTGATTTGCTGGCAGTTATATTAAGTAAATTTGTTGGTTGCGCAATAAAAAAAGTCTCAAAATCAAACAGAGATCACAAAAATTATTAAAATTTTGCTGCAAAAACACTTCAGCAATTACTTCTCTTTTGCTTTATCTGCCCGATTTTGTTCCCGTAACTTTTTTGCCACTAAAGCGATAGCCTCGCCGCTGCCCACGCCTTGCGCCATTAATTCCTGAATTTTTTCCACGGCAAGTTGCTGCTGTTCATGGGTTAAATGTAATAAATCGTTATCTAACATTGCATTTCCTTTATTATTTATACAAAAAGTGCGGTCGTTTTTTTAACTGTTTTTTACCACTGAAATGTCCGCATTAAATGTTTCCATTGTTCATCCAATCCCGCTTCAATGG > 1/1396873‑1397363 | aaaccatttaacaacaccaacttccataattcaaacctcttatggttttttagtccttatagaactacatttacttcaataagacaaaatgccctatcaccttgatttgctggcagttatattaagtaaatttgttggttgcgcaataaaaaaagtctcaaaatcaaacagagatcacaaaaattattaaaattttgctgcaaaaacacttcagcaattacttctcttttgctttatctgcccgattttcc < 1:64235‑M2/2‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |