| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,239,638 | Δ849 bp | intergenic (+100508/+152825) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1239638 | 1240486 | 849 | 66 [0] | [0] 66 | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1239637 | 0 (0.000) | 66 (0.750) | 50/426 | 0.5 | 100% | intergenic (+100507/+153674) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1240487 = | 0 (0.000) | intergenic (+101357/+152824) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
AAATTGGTGCTGGCGGACATTGCGATGCCGAAAATCGAAGATGGGGAAGACGTGCTGGTAAAAGTACTGTATTCGGGGGTATGCGGTTCCGATATTCCGCGCATATTTCACCATGGCACGCATTTTTACCCCATCGTACTAGGGCACGAATTTTGTGGTACGGTAGTGGAAATAGGGAAAAGCGTGACGGAATTCCGCAAAGGGGATTTGGTAGTTTGCGCACCATTACAGCCTTGTTTTGATTGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGGCGCAGGGGTGTAGCGATAAAAATGTGATTGTGGTAGGAGCCGGTACTATTGGCT > 1/1240243‑1240732 | tcgcagtattgaccgacaccatcatagaaaaaatcccgggcttgaataaagtgcatttctccgccgatgatttgcaaaaacgcttcggaccgttcggcgagccggtcaccgtcggttttgtcatggggattattatcggtattttggcgggctatccgttaaaagacattttgcagttagcggtaaaaaccgctgcagtgatgttgttaatgccacgcgtcattaaaccaatcatggacggtttGCgaaga > 1:751927‑M2/245‑251 (MQ=255)tcgcagtattgaccgacaccatcatagaaaaaatcccgggcttgaataaagtgcatttctccgccgatgatttgcaaaaacgcttcggaccgttcggcgagccggtcaccgtcggttttgtcatggggattattatcggtattttggcgggctatccgttaaaagacattttgcagttagcggtaaaaaccgctgcagtgatgttgttaatgccacgcgtcattaaaccaatcatggacggtttGCgaag > 1:722336‑M2/245‑250 (MQ=255)tcgcagtattgaccgacaccatcatagaaaaaatcccgggcttgaataaagtgcatttctccgccgatgatttgcaaaaacgcttcggaccgttcggcgagccggtcaccgtcggttttgtcatggggattattatcggtattttggcgggctatccgttaaaagacattttgcagttagcggtaaaaaccgctgcagtgatgttgttaatgccacgcgtcattaaaccaatcatggacggtttGCgaag < 1:364505‑M2/6‑1 (MQ=255)tcgcagtattgaccgacaccatcatagaaaaaatcccgggcttgaataaagtgcatttctccgccgatgatttgcaaaaacgcttcggaccgttcggcgagccggtcaccgtcggttttgtcatggggattattatcggtattttggcgggctatccgttaaaagacattttgcagttagcggtaaaaaccgctgcagtgatgttgttaatgccacgcgtcattaaaccaatcatggacggtttGCgaa > 1:748997‑M2/245‑249 (MQ=255) 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(MQ=255) atcatggacggtttGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGgcg > 1:74236‑M2/15‑208 (MQ=255) atcatggacggtttGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGGCGCAGGGGTGTAGCGATAAAAAtg < 1:68160‑M2/216‑1 (MQ=255) tcatggacggtttGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGGCGCAGGGGTGTAGCGATAAAAATGTGATTGTGGTAGGAGCCGGTAc < 1:567799‑M2/238‑1 (MQ=255) gtttGCGACGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAatat > 1:408939‑M2/5‑90 (MQ=255) gtttGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTa > 1:195043‑M2/5‑169 (MQ=255) gtttGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGGCGCAGGGGTGTAGCGATAAAAATGTGATTGTGGTAGGAGCCGGTACTATTGgct < 1:493545‑M2/246‑1 (MQ=255) | AAATTGGTGCTGGCGGACATTGCGATGCCGAAAATCGAAGATGGGGAAGACGTGCTGGTAAAAGTACTGTATTCGGGGGTATGCGGTTCCGATATTCCGCGCATATTTCACCATGGCACGCATTTTTACCCCATCGTACTAGGGCACGAATTTTGTGGTACGGTAGTGGAAATAGGGAAAAGCGTGACGGAATTCCGCAAAGGGGATTTGGTAGTTTGCGCACCATTACAGCCTTGTTTTGATTGCGAAGAATGTCACAAAGGATATTATTCATTATGTAAAAACTACAATTTCATCGGTTCCCGTCGCTTCGGCGCCAATGCGGAATATATTTGCGTCAACAAGAAAAATTTGGTGAAAGTATCACCAGATTCCAACCCTTTGCATGATGCTTTTATCGAACCTATTACGGTGGGTCTGCACGCCATTAATCTGGCGCAGGGGTGTAGCGATAAAAATGTGATTGTGGTAGGAGCCGGTACTATTGGCT > 1/1240243‑1240732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |