| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 787,281 | Δ1,650 bp | intergenic (+5/‑28182) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑GAG/tRNA‑Leu‑CAG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 787281 | 788930 | 1650 | 76 [0] | [1] 77 | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/tRNA‑Leu‑CAG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 787280 | 0 (0.000) | 71 (0.930) | 50/372 | 0.3 | 100% | intergenic (+4/‑29832) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/tRNA‑Leu‑CAG |
| ? | 1 | 788931 = | 0 (0.000) | intergenic (+1655/‑28181) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/tRNA‑Leu‑CAG | |||||
TAGCCATCATCATCTTTTCATGGTTGTCACTTGCATGGGGTTAACTTATAAATTGCCGGATCTATTTTTATAGAGTTCGAAAATTCCCTGGCAAGAATCTATTGTTCAATGATTAAGCAAAATAGGGTATGACTTTTTGATTTAGTTATACGTTTAGTTATACGGTAAAGATTTTTAAAAATCTAACTTTAGTAACGATATGGATTGATTTGACTTAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAATGATGAACACAAATGTCAGAC > 1/788686‑789178 | gcaacatcaattcgcacagaaacaacgtaaaacaaggcgcatttgacgatttatccggcacagcggaacaaattcagcagcaacagcaacaacaagcaccagctgtattagacacaaaaaacaacgatattcctcaataaaatttatcaaattaagctctggtggtggaattggtagacacgctatcttgagggggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTaaaa > 1:138364‑M2/246‑251 (MQ=255) 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ggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAAt < 1:889060‑M2/65‑1 (MQ=255) ggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGAt > 1:123421‑M2/52‑216 (MQ=255) ggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAAc > 1:394494‑M2/52‑235 (MQ=255) ggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACAtt > 1:550371‑M2/52‑251 (MQ=255) ggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACAt < 1:194549‑M2/199‑1 (MQ=255) gtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAAc < 1:415579‑M2/184‑1 (MQ=255) gaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGc < 1:563257‑M2/131‑1 (MQ=255) gaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAaatga > 1:86388‑M2/46‑251 (MQ=255) accgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGtt > 1:300206‑M2/45‑92 (MQ=255) accgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATc > 1:812482‑M2/45‑136 (MQ=255) accgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTa > 1:514615‑M2/45‑150 (MQ=255) ccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAg < 1:25103‑M2/7‑1 (MQ=255) tcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGaagaaaag > 1:47478‑M2/37‑183 (MQ=255) tgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTgg < 1:549983‑M2/218‑1 (MQ=255) gttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGAt > 1:160071‑M2/29‑193 (MQ=255) gtctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGt < 1:633935‑M2/47‑1 (MQ=255) tctcgcccagagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAat < 1:346183‑M2/228‑1 (MQ=255) gagcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTgg > 1:545011‑M2/13‑230 (MQ=255) aTTTTTAAAAGAT‑GCCGTTTTGGCGTCTTTTTTTATT‑GTTTTTTTCAAGTTATCTCCCCTACTTTAAATTAAGGATTTTTTTAGAAAAAAATTAT‑TGGTTCCCTTTCTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAATGATGAACACAAATGTCAGAc < 1:791857/251‑1 (MQ=255) ttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCcttc < 1:123759‑M2/103‑1 (MQ=255) | TAGCCATCATCATCTTTTCATGGTTGTCACTTGCATGGGGTTAACTTATAAATTGCCGGATCTATTTTTATAGAGTTCGAAAATTCCCTGGCAAGAATCTATTGTTCAATGATTAAGCAAAATAGGGTATGACTTTTTGATTTAGTTATACGTTTAGTTATACGGTAAAGATTTTTAAAAATCTAACTTTAGTAACGATATGGATTGATTTGACTTAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAATGATGAACACAAATGTCAGAC > 1/788686‑789178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |