| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 740650 | 115 (1.300) | 5 (0.060) | 5/418 | 6.3 | 4.4% | intergenic (‑17936/‑46541) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| ? | 1 | = 740784 | 106 (1.240) | intergenic (‑18070/‑46407) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AACTTGAGCAAACAAATAATAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATACAAATGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGCTTTATCCGTTGCAGGAATGGGAAGTTATTGAACAAAAGCTACTCGAACTTTCCAACTTTGATCCTGTACAACGCAGTTTGCAACGGGTGATGTTGGGTTATGCCACCGAGTGTGAGTTGGATAGTGCAGGGCGGATTTTAATTAGCGGTCCACTGCGCCAACACGCCAAATTAGAAAAATCCATTATGCTGGTCGGGCAATTAAATAAATTTGAAATCTGGAGTGATGCGGAATGGAAAGC > 1/740537‑741033 | aaCTTGAGCAAACAAATAATAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGttt < 1:504568/251‑1 (MQ=255) aGCAAACAAATAATAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGc < 1:274612/250‑1 (MQ=255) aGCAAACAAATAATAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGc < 1:320348/250‑1 (MQ=255) caaaTAATAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGCTTTATcc < 1:774159/251‑1 (MQ=255) aataatAAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGCTTTATCCGt > 1:188253/1‑251 (MQ=255) ataataAACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGCTTTATCCGtt > 1:109077/1‑251 (MQ=255) taataaACTTAGCGAAAAGTGGTGGAAAGTGGTTTTTTGTGGAGAATTTTGGAAATAAATCCCAAATTCTGACCATCCAAACGGAAAAAAGGAATAAATTCATGTTTCGTGGAGCTTCGGCGGTTAATTTAGATGCGAAGGGTAGAATTTCTATCCCGACCCGCCATCGCGCCGAACTTTTGGAACAAAATCAAGGGCAAATGGTTTGCACCGTGGATATTCGTCAACCTTGTTTATTGCTTTATCCGTTg > 1:243315/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |