| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | = 1347303 | 1 (0.010) | intergenic (+208173/+46008) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ATATATGCAGGTAATGTCATATCGCGAATATCAAAGCGCTGTTTAGTATATTCCATAACCGCCCCGAGATAATGTTGCTCGGAAAAGTGATAACCCGGGCGGAAAAACCAAGATTGACTACGAGATTTCATCGGGTTCGGCGCAACACGATTCTCACCGGTATACTCTCCCTGACTAGCCGTCTCTTCTTGCTCAGGAATAACTCTTGCCAGTGGCTTTATGTAACCTTTGCATAAATCAACATTACCGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTT > 1/1347053‑1347545 | tatttaaacgggctataaacgttttttaaacgcctttttgtttttctacaattaagtggctaaaccgccctttttagattttagccactttttttctaaaactaactttaacgacaaaaccacccaataaaaaagggccaaaacttctttcagccctttatttcattgattctgccccgcttaattccgtttaattcaacttaagtcctaacctgttatcaatttctaatattaagtggttggttacagga < 1:194881‑M2/3‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |