| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 443,171 | +GGCGGT | intergenic (+79754/‑128848) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 443170 | 7 (0.080) | 82 (0.960) +TGGCGG |
55/416 | 0.3 | 92.3% | intergenic (+79753/‑128849) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 443171 = | 7 (0.080) | intergenic (+79754/‑128848) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
TGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATCTAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTTATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTCCGTTAAATTTGAGGGTTGTTAGTTGTTGGT > 1/442930‑443418 | cattatcgctgcagattacgctttaatcgcatgcgaagaaagcgggtatgatgactattcgagagaatgtgcagacgcacacttggattttctacaagatgcgggagctaaatttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGtttt > 1:355614‑M2/242‑251 (MQ=255) atcgctgcagattacgctttaatcgcatgcgaagaaagcgggtatgatgactattcgagagaatgtgcagacgcacacttggattttctacaagatgcgggagctaaatttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGc < 1:488391‑M2/14‑1 (MQ=255) ctgcagattacgctttaatcgcatgcgaagaaagcgggtatgatgactattcgagagaatgtgcagacgcacacttggattttctccaagatgcgggagctaaatttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattcatgatagttaaaaatacgttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGc > 1:222643‑M2/234‑250 (MQ=255) gcagattacgctttaatcgcatgcgaagaaagcgggtatgatgactattcgagagaatgtgcagacgcacacttggattttctacaagatgcgggagctaaatttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGc > 1:240334‑M2/232‑245 (MQ=255) 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(MQ=255) atttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAgg > 1:676878‑M2/131‑155 (MQ=255) atttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAg < 1:816764‑M2/38‑1 (MQ=255) atttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAActgctg < 1:476758‑M2/58‑1 (MQ=255) atttaatagagatgaggcattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGctc > 1:84616‑M2/131‑215 (MQ=255) 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1:379077‑M2/136‑3 (MQ=255) cattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGaa < 1:115508‑M2/93‑1 (MQ=255) cattagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTtaagctc < 1:156422‑M2/137‑4 (MQ=255) ttagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTAc < 1:168102‑M2/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAAcgg > 1:489507‑M2/79‑250 (MQ=255) gattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCCGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAacggg > 1:788641‑M2/79‑250 (MQ=255) ttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATAcc < 1:505072‑M2/184‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTtgtttatgtt < 1:662066‑M2/203‑1 (MQ=255) gaccgttactaatcaaaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAAc > 1:125852/15‑148 (MQ=255) caattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTtata < 1:639172‑M2/207‑1 (MQ=255) 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ttactaatcaaaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTCATTTACTGCCGAATAGGCAgcttagaaa > 1:104402/10‑197 (MQ=255) ggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGaaa < 1:383722‑M2/122‑1 (MQ=255) ggattaagatgtaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAAtagtag < 1:518242‑M2/129‑1 (MQ=255) gattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATtc < 1:179525‑M2/216‑1 (MQ=255) 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atctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGGAATACCCCTCGGTTTTGTTTTTGTTTTTATTATGGTTCTGCGGTtaattttagggcgattagt > 1:279353‑M2/10‑242 (MQ=255) cggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTctgcgttaaatttgagggcgattagtcgttatt < 1:321418‑M2/248‑16 (MQ=255) cggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTctgcgttaaatttgagggcgattagtcgttatt < 1:859078‑M2/248‑16 (MQ=255) aTCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACtc > 1:9770/1‑138 (MQ=255) | TGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATCTAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTTATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTCCGTTAAATTTGAGGGTTGTTAGTTGTTGGT > 1/442930‑443418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |