| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 441881 | 0 (0.000) | 46 (0.750) +GCACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCGGCTTCAGCTTGGGTTAGTTGGATTGGTGGATAT |
23/300 | 1.3 | 97.1% | intergenic (+78464/‑130138) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1037242 = | 4 (0.050) | intergenic (‑112525/‑77866) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
GTTGAAAGAAATTTCAGCCCTTTTTTATTTAGAGGATAAAAGGAAAAATCAAAATTAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGG‑‑‑‑GCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAATAAATCTATTAAAGGCTAATGCTG > 1/1037000‑1037384 | gaaataaagggctgaaagaagttttggcccttttttattgggtggttttgtcgttaaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTctt > 1:887713‑M2/247‑250 (MQ=255) aaataaagggctgaaagaagttttggcccttttttattgggtggttttgtcgttaaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTctt > 1:369694‑M2/246‑249 (MQ=255) 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GTTGAAAGAAATTTCAGCCCTTTTTTATTTAGAGGATAAAAGGAAAAATCAAAATTAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGG‑‑‑‑GCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAATAAATCTATTAAAGGCTAATGCTG > 1/1037000‑1037384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |