| New junction evidence | |||||||||||
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TTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTTATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTCCGTTAAATTTGAGGGTTGTTAGTTGTTGGTGATGTGTAAAATTTACGTAGTGTTACTTAATTTAAAACCATATAAATTTAGAAAATTTATTTCTAGTTTTATATGGTTATTTTTCTAAAATCTCGCGGTCGGCTACACGCAAAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGATTCGCAATTAATTCATAATGTTATCAAAAAT > 1/443286‑443776 | ctttattaatggtgccgagaaacaggcgttcctgcttaatcaggcgatgttggttatccagaaaaagcaccataaaaatttcccgctcgatatttgccagctccgtctgtaagtacattttcacaatgtcggttgaagtaaaacagtgggtctcttttaattctgcaaacaaataacggcgggtcatttcagtacaggcttgcagctgaataaactgcgtaacgccaatgcctttcacagcgcaaAACTg < 1:9799‑M2/5‑1 (MQ=255) 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1:868942‑M2/215‑1 (MQ=255) aaactgcgtaacgccaatgcctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTc < 1:469868‑M2/94‑1 (MQ=255) aaactgcgtaacgccaatgcctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGAtt < 1:643875‑M2/217‑1 (MQ=255) ctgcgtaacgccaatgcctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGATTCg > 1:419472‑M2/32‑250 (MQ=255) gcgtaacgccaatgcctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTaa > 1:848038‑M2/30‑184 (MQ=255) 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1:154374‑M2/235‑1 (MQ=255) cctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGATTCGCAATTAATTCATAATg < 1:537478‑M2/235‑1 (MQ=255) cctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGATTCGCAATTAATTCATAATg < 1:123371‑M2/235‑1 (MQ=255) cctttcacagcgcaaAACTGCTTTTGGTCGGCACGAATTAACTCGCGTAAAGAACCAAAATGTTGCAATACATTTTTCGATAACTGCATCACCGGGCAGTCCTTAATTCCCGTACGCAAAAAGATCGCCAATAGTTCATCGTCCGTCAAAGCGGCAGCACCGTATTTTAATAGCTTTTCCCTTGGCATTAATGCTTCATTCATTTGCCGAACCTCTCTAAAAACAAAAGATTCGCAATTAATTCATAATGt < 1:284350‑M2/236‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |