| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 2426 = | 0 (0.000) | 68 (1.000) | 46/332 | 0.2 | 100% | intergenic (–/+4) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | = 2101759 | 0 (0.000) | intergenic (‑202016/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– | |||||
AAGACTTCCGTTTTCACGACTTGCGCCATACTTGGGCGACAAGACACATTATGTCGGGAACGCCGTTATATGTGCTGCAAGAGTTGGGCGGGTGGAGTAAATCAGACACCGTGAGAAAATATGCGCATTTATCTGTTGAGCATTTACAAAACCACGCCAACAATGTTCAACTTTTTGCCACAAAATTGGCACAAACACAAAAAGGAAAAAACCTTATCAATCACTAACTAATTGATAAAGCTATAAAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTG > 1/2180‑2675 | agcatgaaccgctagcgatttgacttaaacagagatggataaatagaatcttcaaagcgcaaatttaaaacttgaatgaggaagaaccgaaataactaacttactgaagtgattgtctagcgtggagcgcattagaacacacccgggaaatgaaaacaatctattttattgaatttacatgcttgtctaatcagctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggAAttt < 1:773045‑M1/5‑1 (MQ=255) 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1:795410‑M1/198‑1 (MQ=255) tcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGc > 1:722271‑M1/50‑251 (MQ=255) ggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgatagggttttggAATTTGGAGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAg > 1:814030‑M1/48‑147 (MQ=255) aacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATc > 1:795419‑M1/42‑189 (MQ=255) tgataggattttggAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAgg < 1:415467‑M1/237‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |