| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 326937 | 2 (0.020) | 15 (0.180) +TAATTAGCAGA |
16/400 | 3.1 | 88.7% | intergenic (‑42308/‑36390) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| ? | 1 | 326938 = | 2 (0.020) | intergenic (‑42309/‑36389) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/326698‑326937‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGAGAAAAAAGCAGCAGAGCACAACAAGAAAATGATGCACTACGTGGTGAAAACGAACAA > 1/326938‑327173 ||||||||||| GAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATT > 1:241755/1‑245 AATTAAGTCCAGCATATACCGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGAT < 1:736801/251‑1 ATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATA > 1:887733/1‑251 GCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTC > 1:71645/1‑250 GCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAG > 1:824001/1‑251 CCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATC < 1:877230/251‑1 CGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATT < 1:740075/180‑1 CTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTT > 1:214495/1‑238 TCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAAC < 1:46596/251‑1 TCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGC < 1:744931/251‑1 GTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATC < 1:372883/177‑1 TCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTC > 1:231044/1‑124 ATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAAC > 1:562976/1‑250 AAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTT < 1:356858/169‑1 GTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAG < 1:161273/226‑1 GTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAG > 1:42195/1‑153 TTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGA > 1:818324/1‑251 GAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGAGAAAAAAGCAGCAGAGCACAACAAGAAAATGATGCACTACGTGGTGAAAACGAACAA > 1:457179/1‑251 GAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGAGAAAAAAGCAGCAGAGCACAACAAGAAAATGATGCACTACGTGGTGAAAACGAACAA > 1:874755/1‑251 GAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGAGAAAAAAGCAGCAGAGCACAACAAGAAAATGATGCACTACGTGGTGAAAACGAACAA > 1:113041/1‑251 GAATTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGAC > 1:531821/1‑122 TTAATTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGT < 1:851348/102‑1 TTAGCAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAAT > 1:573239/1‑89 CAGATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTT > 1:439778/1‑90 ATAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTA < 1:390630/177‑1 ||||||||||| GAATTAAGTTCAGCATATAACGCATGGCTTTCACCGCCGCATCATCCGCTGCATTTTTATCCCCGCGCCCCAACCAGGCAAAACCGGCTAACGCGGCAACTTCCGTAACTCTTGAAAATTCAATGGCTAATGCTCTGTTCATAATGTATCCCTTAAAATAAAAATGTGAAATAGGTCCATTTTAGCACTAAGCAAACGATTGCATACTAAAATTTAAGAGAAAATTTTAATTAAAAGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/326698‑326937‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCGATTCTTTGCTTTAAAAAAGACGATTAAGTAAGGTAAAATATGGCTACTTTACATCCATTTGTTTTAGAGGAAATTACTTATGTCACTAGAAATTCTAGACCAGTTAGAAAACAAGATTAAACAAGCTGTCGAAACCATTCAGTTGCTTCAATTGGAAGTGGATGAATTAAGAGAAAAAAGCAGCAGAGCACAACAAGAAAATGATGCACTACGTGGTGAAAACGAACAA > 1/326938‑327173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |