| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 256,910 | Δ393 bp | intergenic (‑43026/+22381) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 256910 | 257302 | 393 | 121 [0] | [0] 121 | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 256909 | 0 (0.000) | 120 (1.370) | 78/426 | 0.0 | 100% | intergenic (‑43025/+22774) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 257303 = | 0 (0.000) | intergenic (‑43419/+22380) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CCTTTTATCAGCTATGCCAGAACCCATAGAATGCCGAATATTCAGGAAATGTATTTTTCACAAATCGGCGATTCCGGTGTGAATACCAACTTAAAACCCGAACGTGCGGATACCTATCAAATCGGTTTTAATACGTTCAAAAATAATGTGTTCCTGGATGATGATGTATTGGGTTTAAAAGCCGTGTTTTATCGTAGCCGCATTAAAGATTACATTCATAATGTTTATGGTAAATGGTGGAATACTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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1/256661‑256909‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaCCCGGCAATACCGCTGATCCGCATAATATCGGCAAACGTGTGATTAAAGAAACCGAGACTATTGATAAGCAACCGTTGGTGGTTGATTTCTATGTGGCGTATGAACCCGTCGAAAATTTAGTCATTCGCGCGGATATACAAAATGCCTTTGATAAAAGATATATTGACCCGTTGGATGCCGCAAATGACGCAGCAACCCAACGCTATTTCTCCACCTTTGAGAATCTCAATTCCTATGGAGATGATAT > 1/257303‑257550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |