| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 97911 = | 110 (1.250) | 89 (1.030) | 55/420 | 0.3 | 62.4% | intergenic (+93304/+32594) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 1412701 | 0 (0.000) | intergenic (‑19314/+604) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
CTAAATACAAAGACAGTGGAGGAGTATATAAGGAATCAGGAAAAGGAAGACATGATTCAGGATAATTTATCGAAGAAAGGATATGTGGACCCCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/98125‑97911‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gattgGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACCCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGACAGAATAGTAGTGTCCGACACTGGTGAACAG < 1/1412701‑1412455 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gcttagaacggATATAAGGAATCAGGAAAAGGAAGACATGATTCAGGATAATTTATCGAAGAAAGGATATGTGGACCCCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAA > 1:342980/12‑251 gcttagaacggATATAAGGAATCAGGAAAAGGAAGACATGATTCAGGATAATTTATCGAAGAAAGGATATGTGGACCCCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAA > 1:299171/12‑251 gcttagaacggATATAAGGAATCAGGAAAAGGAAGACATGATTCAGGATAATTTATCGAAGAAAGGATATGTGGACCCCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTG < 1:488619/206‑1 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CCTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTG < 1:621695/233‑1 CTTTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAG > 1:764649/1‑250 TTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACt > 1:150086/1‑195 TTAAGGGGTAGGTCATAGAGTTATTTCACGGTTGTTGGTTTTCATATGCCCTTTGAAGGGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAAT < 1:357829/244‑1 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GGCATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATC < 1:97755/249‑1 CATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATG < 1:541001/251‑1 CATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATG > 1:549567/1‑251 CATGTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCG < 1:510836/201‑1 GTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGG > 1:271928/1‑251 GTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGG > 1:364035/1‑251 GTGAAGTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACA > 1:190001/1‑239 GTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCA > 1:125146/1‑251 GTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGC > 1:682730/1‑185 GTACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACG < 1:605009/89‑1 TACTAGGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCAT < 1:825333/251‑1 GGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTG > 1:514175/1‑250 GGTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAG > 1:688694/1‑205 GTCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCA > 1:322616/1‑251 TCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCAT < 1:480612/206‑1 TCCTTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATAC < 1:868012/119‑1 TTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGC < 1:416616/208‑1 TTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCAT > 1:692027/1‑203 TTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGC < 1:490361/201‑1 TTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAG < 1:35914/169‑1 TTATAGAGTAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGG > 1:471464/1‑122 TAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGAC < 1:604463/251‑1 TAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGAC < 1:10430/251‑1 TAGCCTAAAAACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGAC < 1:22532/251‑1 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< 1:521896/251‑1 ACCGCACGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGACAGAATAGTAG < 1:108852/251‑1 CGTTTTACGTGCGGATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGA < 1:629839/202‑1 GATTGGTTTTTGAATTTTGTGTGCTGGATCACGATTTAACGTTTCTTAAAGATAAGCACCAACAAGGCGAGGACAATACTCGTGGTGATGAATCCAAGTAAACCGGAATAAGTGAAACCAACTACAATATAGCCTGCAATGCTCGCGGTGGCGATGGTGATAGCATAAGGCAATTGGGAAGTGACATGATCCATGTGGTCGCATTTTGCACCGGTGGAAGACAGAATAGTAGTGTCCGACACTGGTGAAC < 1:344164/250‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |