| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,827,801 | (T)6→7 | intergenic (+45901/+7583) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,827,795 | 1 | . | T | 100.0% | 228.1 / NA | 76 | intergenic (+45895/+7589) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (41/35); total (41/35) | |||||||||||
GTTCAATAATGGTGCGGTTATTCACCAACGTGCCATCCCGATTTAAGCGCAGATTATTTACGGTTGTTAAATTGTGTTCAGGGTAAATACTGGTACATTGCCATTCCCCGCTCACTTTGCGTTGGGTAATTTTACCATTGTCTATTAAATCCGTAAGCGTACAGCCGCTCAAAAAAGACAGGGTTAATCCGAGTAAAAATAATTTTTTCATTTGCATCTCCTCTAAAAGTGCGGTGCA‑TTTTTTCAGTG‑TTTTTTATTCCTAATAGGGAATGTCCAAAATACGACAAGGATTTTTTATTGTAATCCATGTAATACGCTTATTTCTGAGTAAGTGCGGAAAAGAATTTACACCAAGTGCGGTCGTCTTACAAAACGTTTTTCATTATCAGAAAAGTACCAACCTGTTTGCAGATTCGCGCTTTAATGGAACAAATCTAAATCACATTTTTAGCATTTGAAGGGAGTGGAAAGACTGAAGAAAATAAAGAAAGC > 1/1827547‑1828038 | gTTCAATAATGGTGCGGTTATTCACCAACGTGCCATCCCGATTTAAGCGCAGATTATTTACGATTGTTAAATTGTGTTCAGGGTAAATACTGGTACATTGCCATTCCCCGCTCACTTTGCGTTGGGTAATTTTACCATTGTCTATTAAATCCGTAAGCGTACAGCCGCTCAAAAAAGACAGGGTTAATCCGAGTAAAAATAATTTTTTCATTTGCATCTCCTCTAAAAGTGCGGTGCA‑TTTTTTCAGTG‑tt > 1:817268/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |