| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,776,532 | +T | intergenic (+134174/‑5193) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,776,528 | 1 | . | T | 100.0% | 257.2 / NA | 90 | intergenic (+134170/‑5197) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (50/40); total (50/40) | |||||||||||
GACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCAAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑TTTTACAGGGGATTATTTTTCTTTCCCGCAAATTAAAAAAATTTCCGTAAAAATCATTGATTAGAAAACGGCTAGGTGATAAAACGTAACCCTCTTTTTATTTATTTTAAGGAAATAATTATATGGCGAACGTATTTAATTTCAGTGCCGGTCCGGCGATGATGCCGCAAGCGGTGTTAGAACAGGCGCAACAAGAATTACTGAACTGGCAAGGGCAAGGCACTTCGGTGATGGAAGTTAGCC > 1/1776283‑1776771 | gACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCGAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑ttttt > 1:352539/1‑250 (MQ=255) 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GACATATCGTCACGAATGTACTGATCTAAGTTTTGTAACAACAATACGCGTTTCTGGTTATCACGGATTTTACGATTATTATCGTCCATATCGCGCAATAGTTTATTTTTTAAGCGATACATACGCACATACTCCAAAACATCCTGAAAAGATTTATTCACATTGTCCATCAATTTGCTCCCTTGTTATAAAAAATGAATGGCGATAATGTAGCCTTTTTTGTGAATTTCGTCAAAAAATTCGCAC‑TTTTACAGGGGATTATTTTTCTTTCCCGCAAATTAAAAAAATTTCCGTAAAAATCATTGATTAGAAAACGGCTAGGTGATAAAACGTAACCCTCTTTTTATTTATTTTAAGGAAATAATTATATGGCGAACGTATTTAATTTCAGTGCCGGTCCGGCGATGATGCCGCAAGCGGTGTTAGAACAGGCGCAACAAGAATTACTGAACTGGCAAGGGCAAGGCACTTCGGTGATGGAAGTTAGCC > 1/1776283‑1776771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |