| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,225,144 | +G | intergenic (+86014/+168167) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,225,142 | 1 | . | G | 100.0% | 193.8 / NA | 69 | intergenic (+86012/+168169) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (30/39); total (30/39) | |||||||||||
GCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCGGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGC‑GGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAAATGAATGAGTGAAAAGTGCGGTCATTTTAACGAATGTTTTTTTTAAATAAAGGCTTTTCT > 1/1224904‑1225376 | gCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCAGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGC‑gggttg < 1:885242/245‑5 (MQ=255) 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gtcgtcGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAgct > 1:537346/1‑101 (MQ=255) gtcgtcGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTg < 1:188382/142‑1 (MQ=255) gtcgtcGGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAAATGAATGAGTGAAAAGTGCGGTCATTTTAACGAATGTTTTTTTTAAATAAAgg > 1:789072/1‑251 (MQ=255) gtcgGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAAc < 1:451459/137‑1 (MQ=255) cgGTTGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTc < 1:282662/176‑1 (MQ=255) ttGACCGCGTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAAATGAATGAGTGAAAAGTGCGGTCATTTTAACGAATGTTTTTTTTAAATAAAGGcttttct < 1:467361/250‑1 (MQ=255) gTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAaatg < 1:615263/185‑1 (MQ=255) gTAGGGCGGGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAAATGAATGAGTGAAAAGTGCGGTCATTTTAACGAATGTTTTTTTTAAATAAAGGc < 1:390832/236‑1 (MQ=255) | GCTAATACCACGGCTTTTTTGCCTGTTAATAATCCTTCAGGGCCTTCCTCCGTATATTGAAATGTTACGCGAGGGCGTGCAATGAAATCAAAATAGCTTTTTAATTGGGTAGGGATATTAAAATTATACATCGGTGCATTGATGATAATGGTGTTTGCGTTTTTAATTTCGGCGACTAATTCATCAGATAACGCCAATAATGCGTTTTCTTCCGCTGTCGTCGGTTGACCGCGTAGGGC‑GGTTGTGGCAGTGGCACCAAAGTGGGGAAGTTGATTTACTGCAAGATCGCGCACGGCGATATTTTTGCCTGTAAGCTTGCTTTCCAAATAATCAGATAATTGATTGGTTTGTGAACTGTCTGCCAGAATACTGGATTTTAATACAAGAACGTTGTTCATTTTGTTCCTTCCTAAATGAATGAGTGAAAAGTGCGGTCATTTTAACGAATGTTTTTTTTAAATAAAGGCTTTTCT > 1/1224904‑1225376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |